128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4255 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  100 
 
 		 257 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  71.66 
 
 		 249 aa  349  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  62.17 
 
 		 254 aa  288  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  48.39 
 
 		 253 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  44.62 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2258  putative hydratase/decarboxylase  45.02 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0643634  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.29 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.94 
 
 		 254 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  35.6 
 
 		 256 aa  119  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3930  hydratase/decarboxylase  36.2 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0554783  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  32.92 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.4 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.66 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5145  putative hydratase  32.27 
 
 		 257 aa  89.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0494321  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  31.45 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.45 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.45 
 
 		 253 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  30.65 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.45 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.74 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0561  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  29.7 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  29.46 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2908  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  27.95 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  32.31 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  32.31 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0650  putative hydratase  31.08 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  32.31 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5795  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.22 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  29.48 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  31.78 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0212  hypothetical protein  30.2 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  29.96 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3428  hydratase/decarboxylase family protein  29.31 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0577  hydratase/decarboxylase family protein  29.72 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1182  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.69 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0548  hydratase/decarboxylase family protein  28.92 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0633  hydratase/decarboxylase family protein  27.6 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  27.09 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5798  hydratase/decarboxylase family protein  28.44 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000214426  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.5 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0572  hydratase/decarboxylase family protein  28.92 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0524  hydratase/decarboxylase family protein  28.88 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3602  hydratase/decarboxylase family protein  29 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.2 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3446  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  29.95 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3762  hydratase/decarboxylase family protein  28.51 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3592  hydratase/decarboxylase  28.51 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2652  hydratase/decarboxylase  27.85 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.57 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.04 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1165  putative hydratase protein  27.73 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.69 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2159  hydratase/decarboxylase  27.4 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.05 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.38 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0259  hydratase/decarboxylase  23.42 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000347099  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  28.03 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2055  2-keto-4-pentenoate hydratase  27.62 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.247079  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.59 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6716  hypothetical protein  28.08 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.98 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5815  hypothetical protein  27.09 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3056  hydratase/decarboxylase family protein  31.25 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1904  hydratase/decarboxylase  24.17 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3153  hydratase/decarboxylase  26.82 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3044  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  25.2 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.59 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2075  hydratase/decarboxylase family protein  25.32 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488863  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  27.94 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2038  putative hydratase  33.18 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.59 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.27 
 
 		 263 aa  52.4  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  28.34 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  24.41 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00080  conserved hypothetical protein  26.49 
 
 		 387 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  25.11 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.11 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  25.11 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.4 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.76 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.73 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.73 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  24.67 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.86 
 
 		 288 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  24.67 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  24.67 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  24.67 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.4 
 
 		 280 aa  48.9  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.66 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5500  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.65 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.17 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.08 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.59 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.13 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1790  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.73 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0308919  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  24.71 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  23.64 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.59 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  24.62 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>