85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0742 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  100 
 
 		 281 aa  551  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1767  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  45.49 
 
 		 271 aa  218  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0237  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  38.91 
 
 		 311 aa  187  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3511  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  39.69 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3044  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  34.78 
 
 		 260 aa  149  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.07 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01499  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  29.76 
 
 		 482 aa  86.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  30.26 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  30.51 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0262  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  40.45 
 
 		 110 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  25.1 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  25.84 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  27.08 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  25 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  25 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  25 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  28.14 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  25.67 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  25.29 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0633  hydratase/decarboxylase family protein  24.9 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3428  hydratase/decarboxylase family protein  25 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  27.43 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0548  hydratase/decarboxylase family protein  23.46 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3762  hydratase/decarboxylase family protein  24.14 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0524  hydratase/decarboxylase family protein  24.58 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0200  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  24.89 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.428998  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.07 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.07 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  23.53 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.07 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5798  hydratase/decarboxylase family protein  23.7 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000214426  normal  0.683371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.38 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  26.38 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0577  hydratase/decarboxylase family protein  23.08 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.38 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.38 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0572  hydratase/decarboxylase family protein  22.69 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.25 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  23.69 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  23.53 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3602  hydratase/decarboxylase family protein  23.65 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  28.28 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  23.67 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  26.23 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.43 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.89 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0876  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.08 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  25.44 
 
 		 261 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.75 
 
 		 274 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.75 
 
 		 274 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.89 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.29 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  24.9 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  27.19 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  25.96 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.08 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2258  putative hydratase/decarboxylase  30 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0643634  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.16 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.37 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.79 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.75 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.22 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.21 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.67 
 
 		 264 aa  45.8  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.52 
 
 		 269 aa  45.8  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3153  hydratase/decarboxylase  25.32 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.9 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.69 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  21.68 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  25 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  24.64 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5795  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  23.21 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.79 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  35 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.63 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  25.55 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.57 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  23.2 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2038  putative hydratase  26.8 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.36 
 
 		 261 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5826  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  26.61 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242898  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.68 
 
 		 273 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2652  hydratase/decarboxylase  25.31 
 
 		 261 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.45 
 
 		 261 aa  42.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0061  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  21.16 
 
 		 259 aa  42  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>