20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0262 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0262  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  100 
 
 
110 aa  219  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0237  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  64.55 
 
 
311 aa  147  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1767  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  44.21 
 
 
271 aa  84.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3511  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  36.63 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  40.45 
 
 
281 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3044  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  32.53 
 
 
260 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01499  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  30.61 
 
 
482 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0200  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.66 
 
 
260 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.428998  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  34.72 
 
 
262 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.94 
 
 
260 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.03 
 
 
261 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.94 
 
 
260 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.94 
 
 
260 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.25 
 
 
264 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.11 
 
 
262 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.11 
 
 
257 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.94 
 
 
260 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.29 
 
 
261 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.29 
 
 
261 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.29 
 
 
261 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>