236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0200 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0200  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  100 
 
 
260 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.428998  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0876  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.96 
 
 
256 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355708 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5826  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  34.02 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242898  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.56 
 
 
264 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1767  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  32.1 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  32.68 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.4 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.48 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  27.36 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.91 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.79 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.79 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.8 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0237  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  26.38 
 
 
311 aa  62.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.61 
 
 
254 aa  62  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.3 
 
 
261 aa  62  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.68 
 
 
260 aa  62  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0240  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.18 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1476  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.79 
 
 
260 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.33 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.58 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.54 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.54 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  40 
 
 
263 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2033  putative 2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase(HpaH)  28.11 
 
 
267 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25595  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.04 
 
 
264 aa  59.7  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3897  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  27.14 
 
 
321 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  26.99 
 
 
253 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  29.28 
 
 
254 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3947  hydratase/decarboxylase  25.68 
 
 
321 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  hitchhiker  0.00797291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2038  putative hydratase  27.35 
 
 
268 aa  58.5  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.47 
 
 
264 aa  58.5  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.68 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0971  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.93 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0126306 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  27.43 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  27.43 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20020  2-oxohept-3-enedioate hydratase  39.36 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  27.43 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5829  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.19 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193631  normal  0.310568 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  29.28 
 
 
366 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  23.95 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3417  hydratase/decarboxylase  50.82 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.375509  normal  0.976889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  24.89 
 
 
281 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.52 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2889  hydratase/decarboxylase  32.28 
 
 
169 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.23 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.2 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.74 
 
 
275 aa  56.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  29.28 
 
 
254 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.86 
 
 
274 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.27 
 
 
264 aa  55.5  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  39.76 
 
 
261 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  27.87 
 
 
266 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.23 
 
 
260 aa  55.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  26.61 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.68 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  27.57 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  27.57 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.480508 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00080  conserved hypothetical protein  43.33 
 
 
387 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.47 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3930  hydratase/decarboxylase  40.96 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0554783  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  35.96 
 
 
267 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.71 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.16 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.06 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3129  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36 
 
 
266 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159572  normal  0.889794 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.37 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1712  hydratase/decarboxylase  29.46 
 
 
291 aa  53.5  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376649  normal  0.38859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.21 
 
 
264 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.19 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.79 
 
 
261 aa  53.1  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.68 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.26 
 
 
265 aa  52.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  27.31 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.51 
 
 
265 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.12 
 
 
267 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  37.8 
 
 
264 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.55 
 
 
262 aa  52.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.21 
 
 
267 aa  52.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1992  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.07 
 
 
291 aa  52.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.21 
 
 
260 aa  52.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  27.31 
 
 
269 aa  52  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  27.31 
 
 
269 aa  52  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.17 
 
 
260 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.17 
 
 
260 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  27.31 
 
 
269 aa  52  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  24.62 
 
 
274 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3851  hydratase/decarboxylase  33.93 
 
 
256 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0976371  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.59 
 
 
274 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3044  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  31.91 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  39.24 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.67 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3511  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.67 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.92 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.92 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  35.71 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3589  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.59 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.773607 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  27.13 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  26.92 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.9 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>