More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5513 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  100 
 
 		 263 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  36.33 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  37.01 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  36.61 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.77 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.77 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.77 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.77 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.97 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.77 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.33 
 
 		 269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.33 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  35 
 
 		 261 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.74 
 
 		 260 aa  111  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.33 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.41 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.5 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.69 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2038  putative hydratase  34.6 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.75 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.2 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.55 
 
 		 280 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.58 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.51 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20020  2-oxohept-3-enedioate hydratase  35.22 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.77 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  35.06 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.67 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.07 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  34.03 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.98 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.33 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.09 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.93 
 
 		 260 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.12 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2504  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.53 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.42 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.238552  normal  0.686193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.59 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.38 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.92 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.33 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  33.47 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.37 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  33.73 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3088  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.39 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.325663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.88 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.46 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1061  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.33 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.98 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.46 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.22 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.46 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.8 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.46 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.9 
 
 		 260 aa  99.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1158  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.9 
 
 		 267 aa  99  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.33 
 
 		 265 aa  99  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.78 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0943  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.52 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.09 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1135  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioate hydratase  31.52 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.52 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1028  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.52 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  32.13 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2420  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.59 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0105  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.52 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.274919  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1508  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.52 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.58 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0240  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.58 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.14 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.95 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00080  conserved hypothetical protein  30.9 
 
 		 387 aa  96.7  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  32.13 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.07 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.2 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1730  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.52 
 
 		 267 aa  96.3  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.26 
 
 		 260 aa  95.9  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.14 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1708  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.2 
 
 		 268 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.899066  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5928  hydratase/decarboxylase  30.4 
 
 		 268 aa  95.5  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.53 
 
 		 261 aa  95.5  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.92 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3129  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.4 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159572  normal  0.889794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.45 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1627  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.88 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.09 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  35.53 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.02 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  37.07 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.12 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.62 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  33.76 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1476  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.68 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.08 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3589  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.9 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.773607 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.08 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  34.96 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.56 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3457  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.54 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>