270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2889 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2889  hydratase/decarboxylase  100 
 
 
169 aa  335  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.09 
 
 
257 aa  154  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  52.17 
 
 
260 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  50 
 
 
279 aa  144  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  49.37 
 
 
264 aa  143  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  48.81 
 
 
261 aa  142  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  49.07 
 
 
264 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.38 
 
 
260 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  50 
 
 
264 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.42 
 
 
262 aa  134  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  47.88 
 
 
255 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  42.6 
 
 
260 aa  128  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.17 
 
 
267 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.68 
 
 
259 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  43.64 
 
 
261 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.17 
 
 
260 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.47 
 
 
276 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.5 
 
 
262 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.9 
 
 
260 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.61 
 
 
262 aa  125  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.84 
 
 
263 aa  125  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  45.86 
 
 
262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.54 
 
 
261 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.45 
 
 
260 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.45 
 
 
260 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.34 
 
 
271 aa  124  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  44.72 
 
 
260 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.65 
 
 
267 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.28 
 
 
260 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.72 
 
 
268 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.77 
 
 
261 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.72 
 
 
261 aa  120  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.65 
 
 
260 aa  121  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.21 
 
 
261 aa  120  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  40.88 
 
 
262 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.61 
 
 
259 aa  120  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.51 
 
 
269 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.51 
 
 
269 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.48 
 
 
264 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.51 
 
 
269 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.51 
 
 
269 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  41.51 
 
 
269 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.9 
 
 
267 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.51 
 
 
269 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.51 
 
 
269 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.03 
 
 
269 aa  118  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.59 
 
 
260 aa  117  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  43.95 
 
 
266 aa  117  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  42.14 
 
 
264 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.62 
 
 
262 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.99 
 
 
262 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  39.16 
 
 
262 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.18 
 
 
269 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.64 
 
 
262 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.18 
 
 
261 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  40.88 
 
 
264 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  43.2 
 
 
274 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0240  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.07 
 
 
267 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  38.89 
 
 
262 aa  112  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.98 
 
 
261 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.39 
 
 
271 aa  112  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.98 
 
 
261 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1476  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.85 
 
 
260 aa  111  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.94 
 
 
260 aa  111  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.99 
 
 
254 aa  111  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1150  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.36 
 
 
254 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454229  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  40.25 
 
 
265 aa  110  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10590  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  39.88 
 
 
267 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.86 
 
 
260 aa  110  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.12 
 
 
267 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.25 
 
 
263 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.92 
 
 
268 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.56 
 
 
266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0965  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  39.88 
 
 
267 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.2 
 
 
261 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.36 
 
 
268 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  41.1 
 
 
267 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.44 
 
 
273 aa  108  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1158  2-keto-4-pentenoate hydratase  36.9 
 
 
267 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.62 
 
 
257 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.31 
 
 
263 aa  108  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00080  conserved hypothetical protein  38.81 
 
 
387 aa  107  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1061  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.9 
 
 
267 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  40 
 
 
263 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  40 
 
 
263 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.12 
 
 
263 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  41.46 
 
 
261 aa  107  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04226  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  36.31 
 
 
267 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04192  hypothetical protein  36.31 
 
 
273 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3706  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.31 
 
 
267 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0101  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.51 
 
 
277 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  42.68 
 
 
264 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.75 
 
 
262 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4580  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.31 
 
 
267 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20020  2-oxohept-3-enedioate hydratase  39.24 
 
 
261 aa  107  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  40.36 
 
 
273 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.99 
 
 
288 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.55 
 
 
262 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.12 
 
 
266 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.72 
 
 
264 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>