218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3417 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3417  hydratase/decarboxylase  100 
 
 
289 aa  566  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.375509  normal  0.976889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1992  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  71.82 
 
 
291 aa  411  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1712  hydratase/decarboxylase  71.48 
 
 
291 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376649  normal  0.38859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4183  hydratase/decarboxylase  43.84 
 
 
285 aa  225  8e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.817758 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3947  hydratase/decarboxylase  41.76 
 
 
321 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  hitchhiker  0.00797291 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3897  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  41 
 
 
321 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  34.49 
 
 
304 aa  185  9e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0880  hydratase/decarboxylase  43.22 
 
 
282 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.777831 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2771  hydratase/decarboxylase  40.66 
 
 
300 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.751299  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1671  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.33 
 
 
289 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.444038  normal  0.899188 
 
 
-
 
NC_003296  RS01670  hydratase protein  41.79 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.339156  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0828  hydratase/decarboxylase  39.06 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.302369  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.21 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.68 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.24 
 
 
265 aa  79  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.8 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.17 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.91 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.91 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.3 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  29.24 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.3 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1955  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.27 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504182  normal  0.0219036 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.81 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.81 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.17 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.36 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  29.11 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.44 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.81 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  28.81 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.81 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.81 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.51 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  29.31 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1790  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.47 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0308919  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  30.92 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.65 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.17 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1627  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.27 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.29 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.59 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.59 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.8 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.05 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.81 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  29 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2504  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.12 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.62 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.74 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1778  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.7 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1708  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.96 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.899066  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4132  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.17 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138195  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00080  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 
387 aa  67  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  29.3 
 
 
265 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1158  2-keto-4-pentenoate hydratase  25.53 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.91 
 
 
264 aa  67  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1904  hydratase/decarboxylase  26.85 
 
 
270 aa  67  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1182  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.1 
 
 
262 aa  67  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  25.63 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3658  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.7 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.19 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.24 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0061  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  27.67 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1061  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.53 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0259  hydratase/decarboxylase  28.57 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000347099  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.57 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3281  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.7 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0269586  normal  0.185525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4130  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.7 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4236  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.7 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119671  normal  0.0833029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  26.25 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  25.96 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3589  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.67 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.773607 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.82 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4279  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.8 
 
 
268 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00917502  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.77 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  28.23 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.37 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0971  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.64 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0126306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  29.23 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.96 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.52 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.78 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.54 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.78 
 
 
269 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  28.37 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.15 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.66 
 
 
280 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.67 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.77 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  26.19 
 
 
263 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1406  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.03 
 
 
261 aa  63.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3502  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.93 
 
 
267 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  29.34 
 
 
267 aa  62.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  29.74 
 
 
260 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.13 
 
 
270 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  28.23 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.34 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3129  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.94 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159572  normal  0.889794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>