252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1182 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1182  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  100 
 
 		 262 aa  494  1e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.66 
 
 		 274 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.66 
 
 		 274 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.55 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  29.62 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  36 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.46 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.94 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.1 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  32.48 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.38 
 
 		 270 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.67 
 
 		 269 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.53 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.08 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.77 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.89 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.14 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.07 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.7 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.84 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.84 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.75 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.84 
 
 		 261 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.2 
 
 		 261 aa  112  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.64 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  29.52 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.39 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  30.33 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.02 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.91 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  31.28 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.28 
 
 		 265 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.4 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.74 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.2 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.67 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.25 
 
 		 264 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.46 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.44 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.02 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.46 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.74 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.14 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.26 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  31.72 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  36.4 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.69 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.63 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.46 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  34.96 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  36 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  32.02 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.33 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  29.57 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  34.84 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.38 
 
 		 269 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  30.48 
 
 		 265 aa  101  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.57 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.53 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1150  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.73 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.86 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  33.33 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1406  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.19 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  29.57 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  29.57 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.58 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  28.97 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.68 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  29.57 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.5 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  28.51 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  34.42 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.4 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.18 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  35.16 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  32 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.35 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.58 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.58 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.02 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  29.18 
 
 		 269 aa  99  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  29.18 
 
 		 269 aa  99  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  34.7 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.51 
 
 		 271 aa  98.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.89 
 
 		 264 aa  98.6  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  29.02 
 
 		 269 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.62 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.22 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.01 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1627  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.17 
 
 		 267 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.33 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0061  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  27.72 
 
 		 259 aa  96.3  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.72 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.8 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0965  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  30.92 
 
 		 267 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.77 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  32 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9112  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.24 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  30.36 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.82 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>