216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1742 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  100 
 
 
304 aa  609  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3947  hydratase/decarboxylase  51.85 
 
 
321 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  hitchhiker  0.00797291 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3897  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  51.47 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1712  hydratase/decarboxylase  38.85 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376649  normal  0.38859 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1992  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.46 
 
 
291 aa  196  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1671  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.91 
 
 
289 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.444038  normal  0.899188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3417  hydratase/decarboxylase  34.49 
 
 
289 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.375509  normal  0.976889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4183  hydratase/decarboxylase  40.27 
 
 
285 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.817758 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0880  hydratase/decarboxylase  36.54 
 
 
282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.777831 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2771  hydratase/decarboxylase  32.91 
 
 
300 aa  152  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.751299  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01670  hydratase protein  36.54 
 
 
284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.339156  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0828  hydratase/decarboxylase  39.71 
 
 
279 aa  136  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.302369  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0061  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  28.57 
 
 
259 aa  92.4  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.68 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.89 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.87 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.24 
 
 
267 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  25.76 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  23.46 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5040  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.84 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444899  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.88 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.75 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  23.98 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  23.72 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  23.89 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  23.89 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.27 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.31 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  25.76 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  25 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  27.86 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1076  hydratase/decarboxylase  25.31 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0633702  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1790  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.58 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0308919  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  27.03 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.89 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  26.99 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  23.66 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.7 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  23.05 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  23.53 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.43 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  27.38 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.2 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.1 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  23.87 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  23.27 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.52 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  25.25 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0971  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  24.79 
 
 
260 aa  67  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0126306 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3457  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  23.23 
 
 
264 aa  67  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.32 
 
 
259 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2055  2-keto-4-pentenoate hydratase  27.41 
 
 
262 aa  67  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.247079  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  23.87 
 
 
261 aa  67  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.76 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20020  2-oxohept-3-enedioate hydratase  24.76 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.85 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.12 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8638  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  25.54 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  25.7 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.43 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1627  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.05 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4279  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.53 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00917502  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1476  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  24.23 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.11 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.7 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.38 
 
 
265 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.5 
 
 
260 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.81 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.76 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.73 
 
 
257 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  22.13 
 
 
263 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  24.6 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  26.79 
 
 
268 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2941  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioate hydratase  25.81 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  27.09 
 
 
262 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  27.64 
 
 
260 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  24.34 
 
 
269 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  26.21 
 
 
261 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  25 
 
 
264 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.87 
 
 
260 aa  63.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  23.53 
 
 
265 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.7 
 
 
264 aa  62.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3589  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.31 
 
 
268 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.773607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.34 
 
 
261 aa  62.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.07 
 
 
265 aa  62.8  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3129  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.65 
 
 
266 aa  62.4  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159572  normal  0.889794 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  23.64 
 
 
275 aa  62.4  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.34 
 
 
262 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  23.38 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  23.08 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1708  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.61 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.899066  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.98 
 
 
268 aa  60.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1061  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  24.48 
 
 
267 aa  60.5  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.5 
 
 
259 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1955  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.53 
 
 
267 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504182  normal  0.0219036 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  24.38 
 
 
269 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  24.38 
 
 
269 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  24.38 
 
 
269 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  24.38 
 
 
269 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>