247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1076 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1076  hydratase/decarboxylase  100 
 
 
260 aa  511  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0633702  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.38 
 
 
264 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.55 
 
 
261 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.34 
 
 
260 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.36 
 
 
260 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.36 
 
 
260 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.94 
 
 
261 aa  135  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.73 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  35 
 
 
260 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  33.98 
 
 
262 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.2 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.25 
 
 
262 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.63 
 
 
262 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  34.89 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.61 
 
 
267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1790  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.91 
 
 
263 aa  125  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0308919  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.62 
 
 
260 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.32 
 
 
262 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.68 
 
 
262 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.44 
 
 
263 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  33.73 
 
 
267 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.13 
 
 
269 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  35 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.33 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.36 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.12 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  33.86 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  33.46 
 
 
260 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.82 
 
 
260 aa  118  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  35.42 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.9 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.77 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.76 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.46 
 
 
260 aa  115  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  32.48 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.03 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.19 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  33.33 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04226  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  31.6 
 
 
267 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  34.38 
 
 
260 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04192  hypothetical protein  31.6 
 
 
273 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.5 
 
 
263 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4580  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.6 
 
 
267 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3706  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.6 
 
 
267 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0971  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.61 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0126306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.89 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  31.92 
 
 
265 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.87 
 
 
260 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.62 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.62 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  35.27 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.02 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.85 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1627  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.21 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.07 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.04 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4279  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.83 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00917502  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1215  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.86 
 
 
267 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.033694  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3457  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.67 
 
 
260 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1169  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.86 
 
 
267 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135295  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.19 
 
 
265 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.92 
 
 
260 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1200  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.86 
 
 
267 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1180  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.86 
 
 
267 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.850117  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.63 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3502  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.58 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1064  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.86 
 
 
267 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3088  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.33 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.325663  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0965  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  31.82 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.91 
 
 
269 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1476  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.78 
 
 
260 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  32.89 
 
 
264 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10590  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  31.82 
 
 
267 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  32.22 
 
 
264 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  31.47 
 
 
255 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1135  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioate hydratase  31.18 
 
 
267 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.07 
 
 
260 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.18 
 
 
267 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1028  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.18 
 
 
267 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0943  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.18 
 
 
267 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.31 
 
 
261 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0105  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.18 
 
 
267 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.274919  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.91 
 
 
269 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1508  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.18 
 
 
267 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.42 
 
 
264 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5040  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.75 
 
 
260 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444899  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.56 
 
 
268 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.58 
 
 
268 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.49 
 
 
269 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.31 
 
 
261 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1158  2-keto-4-pentenoate hydratase  29.71 
 
 
267 aa  105  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1061  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.71 
 
 
267 aa  105  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3589  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.57 
 
 
268 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.773607 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.49 
 
 
269 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  31.49 
 
 
269 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.49 
 
 
269 aa  105  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.49 
 
 
269 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  33.61 
 
 
266 aa  105  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0630  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.77 
 
 
267 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.337949  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1730  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.8 
 
 
267 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>