240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1671 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1671  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  100 
 
 
289 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.444038  normal  0.899188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4183  hydratase/decarboxylase  43.32 
 
 
285 aa  198  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.817758 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  38.91 
 
 
304 aa  186  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3947  hydratase/decarboxylase  40.54 
 
 
321 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  hitchhiker  0.00797291 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3897  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  40.54 
 
 
321 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3417  hydratase/decarboxylase  46.33 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.375509  normal  0.976889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1992  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.47 
 
 
291 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1712  hydratase/decarboxylase  42.47 
 
 
291 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376649  normal  0.38859 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2771  hydratase/decarboxylase  40.59 
 
 
300 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.751299  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0880  hydratase/decarboxylase  38.71 
 
 
282 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.777831 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0828  hydratase/decarboxylase  40.15 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.302369  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.89 
 
 
265 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01670  hydratase protein  34.87 
 
 
284 aa  99  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.339156  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.67 
 
 
269 aa  99  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.78 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.78 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.61 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.33 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.33 
 
 
269 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.33 
 
 
269 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.67 
 
 
264 aa  95.9  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.33 
 
 
264 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  32.89 
 
 
269 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.89 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.19 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  32.89 
 
 
269 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  32.68 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  34.07 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.6 
 
 
262 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  32.77 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  36 
 
 
264 aa  89.7  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  32.04 
 
 
263 aa  89.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  32.68 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.08 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  31.88 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.67 
 
 
264 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.04 
 
 
262 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.66 
 
 
269 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.59 
 
 
280 aa  86.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  28.97 
 
 
260 aa  84  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.6 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.09 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  30.67 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.19 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.94 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  29.64 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.91 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.22 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.95 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.95 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.37 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  32.07 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  28.23 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.02 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.89 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  30.89 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  28.96 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.81 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3502  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.91 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  30.17 
 
 
260 aa  79  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.69 
 
 
267 aa  79  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.72 
 
 
268 aa  79  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.33 
 
 
265 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.54 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.13 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  31.6 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.36 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.81 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.83 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1061  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.19 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.78 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.5 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.28 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.9 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.77 
 
 
265 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1158  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.71 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  30.15 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.2 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.55 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0965  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  31.78 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.19 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0971  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.84 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0126306 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.55 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.78 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10590  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  31.78 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3088  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.6 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.325663  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.31 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.23 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.36 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.49 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20020  2-oxohept-3-enedioate hydratase  30.24 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  27.56 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.52 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3885  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.33 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.94 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.94 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.79 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.4 
 
 
279 aa  72  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  31.23 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.9 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>