222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4183 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_4183  hydratase/decarboxylase  100 
 
 
285 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.817758 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1712  hydratase/decarboxylase  49.09 
 
 
291 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376649  normal  0.38859 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1992  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.22 
 
 
291 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3417  hydratase/decarboxylase  43.84 
 
 
289 aa  225  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.375509  normal  0.976889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3947  hydratase/decarboxylase  47 
 
 
321 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  hitchhiker  0.00797291 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3897  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  46.54 
 
 
321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1671  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  43.32 
 
 
289 aa  198  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.444038  normal  0.899188 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2771  hydratase/decarboxylase  42.49 
 
 
300 aa  191  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.751299  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0880  hydratase/decarboxylase  39.05 
 
 
282 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.777831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  40.27 
 
 
304 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01670  hydratase protein  39.58 
 
 
284 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.339156  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0828  hydratase/decarboxylase  33.46 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.302369  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.56 
 
 
265 aa  95.9  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.33 
 
 
264 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  34.15 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.98 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  33.18 
 
 
262 aa  93.6  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.94 
 
 
269 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.6 
 
 
269 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.08 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.64 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.27 
 
 
268 aa  89.7  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.17 
 
 
274 aa  89.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.98 
 
 
262 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.11 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.2 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  33.64 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.11 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  32.2 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.11 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.22 
 
 
269 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.73 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.53 
 
 
265 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.67 
 
 
269 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  30.67 
 
 
269 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.14 
 
 
275 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.22 
 
 
269 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.75 
 
 
280 aa  85.5  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.73 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0061  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  25.39 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  32.68 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.76 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.68 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  31.6 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.84 
 
 
264 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.24 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.07 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.29 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.33 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.91 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.71 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.08 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.41 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.43 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1708  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.51 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.899066  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.82 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  30.21 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3589  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.6 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.773607 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20020  2-oxohept-3-enedioate hydratase  31.53 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.76 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.98 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.69 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.57 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.5 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3885  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.3 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4279  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.14 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00917502  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.17 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.85 
 
 
264 aa  77  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.15 
 
 
261 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.13 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.26 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.26 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2456  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.05 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228011  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  29.49 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  28.92 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1643  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  30.05 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2360  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.05 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  30.48 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  28.14 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.2 
 
 
268 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.68 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04226  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  28.03 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1158  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.84 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1135  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioate hydratase  29.72 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.08 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.72 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1061  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.84 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3706  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.03 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1182  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.85 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04192  hypothetical protein  28.03 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4580  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.03 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.87 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.238552  normal  0.686193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.13 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0105  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.72 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.274919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1028  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.72 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0943  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.77 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1508  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.72 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  31.98 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.68 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2941  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioate hydratase  29.86 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>