228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3897 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3897  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  100 
 
 		 321 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3947  hydratase/decarboxylase  96.57 
 
 		 321 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  hitchhiker  0.00797291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  51.47 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1712  hydratase/decarboxylase  44.36 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376649  normal  0.38859 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1992  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  43.98 
 
 		 291 aa  222  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3417  hydratase/decarboxylase  41 
 
 		 289 aa  209  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.375509  normal  0.976889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4183  hydratase/decarboxylase  46.54 
 
 		 285 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.817758 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1671  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.54 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.444038  normal  0.899188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0880  hydratase/decarboxylase  37.94 
 
 		 282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.777831 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2771  hydratase/decarboxylase  33.07 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.751299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0828  hydratase/decarboxylase  36.48 
 
 		 279 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.302369  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01670  hydratase protein  36.78 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.339156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.27 
 
 		 263 aa  92  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0061  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  26.59 
 
 		 259 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.71 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.31 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.85 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.48 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.29 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.29 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.48 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.87 
 
 		 268 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  26.15 
 
 		 262 aa  85.9  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.84 
 
 		 260 aa  85.9  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.32 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  25 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.09 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.55 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  24.3 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2038  putative hydratase  25 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  23.86 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.15 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  24.72 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.98 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.59 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.38 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2941  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioate hydratase  29.11 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.33 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4279  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.72 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00917502  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.68 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  23.64 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  22.39 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  27.27 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  25.1 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1790  4-oxalocrotonate decarboxylase  25 
 
 		 263 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0308919  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.09 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  24.88 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.54 
 
 		 261 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.83 
 
 		 269 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.02 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1182  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.23 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  24.26 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  30 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  23.28 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.21 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1904  hydratase/decarboxylase  26.91 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  23.28 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  25.12 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.64 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.79 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  27.62 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  22.77 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  23.94 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.49 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  24.78 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  23.55 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  23.68 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  24.72 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  23.28 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  22.99 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.91 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  24.71 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  23.28 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  24.52 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  24.52 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  24.3 
 
 		 262 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.7 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1708  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.24 
 
 		 268 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.899066  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  22.9 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.78 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  23.44 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  24.71 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3589  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.22 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.773607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  24.9 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  25.57 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.44 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  24.03 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  23.81 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1643  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  29.25 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  23.19 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  22.22 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  22.14 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2456  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.25 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.01 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  22.05 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.01 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2360  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.25 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  27.94 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  27.87 
 
 		 273 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.49 
 
 		 261 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>