283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2038 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2038  putative hydratase  100 
 
 
268 aa  529  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  50 
 
 
261 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  51.15 
 
 
265 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  35.63 
 
 
263 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  32.2 
 
 
253 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.2 
 
 
253 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.2 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  31.06 
 
 
253 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.68 
 
 
253 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.68 
 
 
253 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0061  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  29 
 
 
259 aa  102  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.3 
 
 
260 aa  102  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.46 
 
 
264 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.6 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.93 
 
 
288 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.19 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  31.3 
 
 
366 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.16 
 
 
266 aa  94  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  30.45 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  31.1 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.84 
 
 
269 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  34.25 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  31.3 
 
 
254 aa  92.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.16 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3428  hydratase/decarboxylase family protein  30.2 
 
 
280 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.87 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3129  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.09 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159572  normal  0.889794 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2504  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.4 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.02 
 
 
260 aa  88.6  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.92 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  28.46 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0259  hydratase/decarboxylase  30.7 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000347099  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.19 
 
 
259 aa  87  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3602  hydratase/decarboxylase family protein  28.91 
 
 
271 aa  87  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.58 
 
 
269 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0971  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.33 
 
 
260 aa  86.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0126306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  30.19 
 
 
262 aa  86.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0524  hydratase/decarboxylase family protein  29.02 
 
 
280 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.52 
 
 
266 aa  85.9  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.56 
 
 
262 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.92 
 
 
261 aa  85.5  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5040  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32 
 
 
260 aa  85.5  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444899  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.45 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.13 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1904  hydratase/decarboxylase  28.63 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.2 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.27 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.45 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  32.95 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.33 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  32.39 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.68 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3592  hydratase/decarboxylase  33.47 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal  0.0625876 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.83 
 
 
269 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.83 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5795  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.74 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.44 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  30.83 
 
 
269 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.95 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.44 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.33 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3947  hydratase/decarboxylase  26.83 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  hitchhiker  0.00797291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0101  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.2 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.47 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4284  hydratase/decarboxylase  32.17 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1061  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.82 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3897  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  25 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  29.5 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2055  2-keto-4-pentenoate hydratase  29.13 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.247079  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1158  2-keto-4-pentenoate hydratase  29.11 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1076  hydratase/decarboxylase  34.08 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0633702  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.4 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.36 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.71 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1476  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.86 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0548  hydratase/decarboxylase family protein  28.41 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0572  hydratase/decarboxylase family protein  27.27 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.38 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.41 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0577  hydratase/decarboxylase family protein  28.41 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.2 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  32.54 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  31.58 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3457  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.05 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.96 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.238552  normal  0.686193 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.33 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8638  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.02 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423963  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.11 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  34.31 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3762  hydratase/decarboxylase family protein  28.03 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  32.39 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.02 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.02 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0633  hydratase/decarboxylase family protein  26.04 
 
 
268 aa  79  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.42 
 
 
259 aa  79  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.86 
 
 
260 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2941  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioate hydratase  29.46 
 
 
268 aa  79  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  37.02 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.33 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.43 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>