284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0175 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  100 
 
 
261 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  62.79 
 
 
265 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2038  putative hydratase  50 
 
 
268 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  36.33 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3592  hydratase/decarboxylase  31.67 
 
 
260 aa  99  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.66 
 
 
264 aa  99  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  33.77 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  35.34 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.47 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.38 
 
 
288 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  32.31 
 
 
253 aa  92  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.88 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.75 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0061  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  27.63 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  32.47 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.74 
 
 
260 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  34.93 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  32.22 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.33 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.22 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.62 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  32.77 
 
 
254 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  33.04 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  31.56 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.78 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  32.77 
 
 
366 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.6 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.35 
 
 
264 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.05 
 
 
267 aa  88.6  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.19 
 
 
253 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  31.33 
 
 
260 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5928  hydratase/decarboxylase  31.75 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.49 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.04 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.8 
 
 
253 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.87 
 
 
260 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.87 
 
 
260 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.19 
 
 
264 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.24 
 
 
277 aa  86.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.75 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.76 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  32.8 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.18 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.71 
 
 
266 aa  85.9  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  33.8 
 
 
265 aa  85.5  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  31.15 
 
 
261 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.37 
 
 
264 aa  85.5  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  31.09 
 
 
254 aa  85.5  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2159  hydratase/decarboxylase  30.26 
 
 
261 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.81 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.06 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.22 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3153  hydratase/decarboxylase  30.04 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3947  hydratase/decarboxylase  24.9 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  hitchhiker  0.00797291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.03 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  33.61 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  35.19 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  32 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1476  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.21 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.07 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.238552  normal  0.686193 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3897  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  24.3 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.47 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.73 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  32.02 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.23 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5040  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.19 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444899  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2410  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.22 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149257  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.43 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.54 
 
 
279 aa  82  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0259  hydratase/decarboxylase  30.09 
 
 
263 aa  82  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000347099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2652  hydratase/decarboxylase  29.82 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  29.32 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  32.17 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.85 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.43 
 
 
262 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.24 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  31.17 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.3 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.17 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.04 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0971  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.74 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0126306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.17 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  31.25 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5795  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.37 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.95 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.5 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  30.59 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.77 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.87 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  32.2 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  33.62 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1076  hydratase/decarboxylase  33.01 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0633702  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3457  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.49 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.93 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.39 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.68 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.02 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  27.67 
 
 
269 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.34 
 
 
260 aa  79  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.7 
 
 
263 aa  79  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>