255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3930 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3930  hydratase/decarboxylase  100 
 
 		 238 aa  447  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0554783  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  55.36 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  42.4 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  43.78 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  36.65 
 
 		 257 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  38.96 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  36.92 
 
 		 249 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.14 
 
 		 260 aa  118  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  35.22 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  35.71 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2908  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  35.97 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5145  putative hydratase  37.17 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0494321  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2258  putative hydratase/decarboxylase  35.71 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0643634  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0212  hypothetical protein  37.19 
 
 		 272 aa  89  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  32.79 
 
 		 269 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0561  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  35.59 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  32.79 
 
 		 269 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  35.24 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  32.39 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  34.07 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  34.55 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.691188 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.98 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.98 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  32.81 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  31.98 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.61 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.95 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.04 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  33.19 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  33.19 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  37.04 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  32.91 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  32.65 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  33.19 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.62 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3446  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  34.68 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0650  putative hydratase  35.11 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.19 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.4 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.3 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.56 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.95 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  29.82 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1165  putative hydratase protein  33.49 
 
 		 251 aa  72  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.74 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.82 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  34.6 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  34.6 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  33.05 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  30.34 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2504  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.67 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  34.6 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.8 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.54 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.81 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.57 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.19 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.04 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2889  hydratase/decarboxylase  34.57 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.8 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.57 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  34.36 
 
 		 263 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.22 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.77 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.42 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  32.89 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.95 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  34.97 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.51 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.3 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.57 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0876  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.37 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355708 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.85 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.33 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.43 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  34.36 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.46 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.89 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.28 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  32.24 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.28 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  32.48 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.4 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  33.19 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  30.57 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.72 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  32 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.75 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.95 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  32.3 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  29.81 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.47 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.96 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.62 
 
 		 274 aa  62  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.94 
 
 		 261 aa  61.6  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.78 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.78 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.73 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2159  hydratase/decarboxylase  29.46 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.82 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>