231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5715 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  100 
 
 
253 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  96.84 
 
 
253 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  92.89 
 
 
253 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  92.89 
 
 
253 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  93.28 
 
 
253 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  92.09 
 
 
253 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  85.04 
 
 
254 aa  427  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  73.62 
 
 
254 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  69.29 
 
 
366 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  69.29 
 
 
254 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  68.9 
 
 
254 aa  345  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5795  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  46.64 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  38.37 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0577  hydratase/decarboxylase family protein  39.37 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5798  hydratase/decarboxylase family protein  44.62 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000214426  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0548  hydratase/decarboxylase family protein  38.98 
 
 
267 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0633  hydratase/decarboxylase family protein  38.43 
 
 
268 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3428  hydratase/decarboxylase family protein  39.25 
 
 
280 aa  178  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0572  hydratase/decarboxylase family protein  38.58 
 
 
267 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3602  hydratase/decarboxylase family protein  38.02 
 
 
271 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3762  hydratase/decarboxylase family protein  38.58 
 
 
267 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0524  hydratase/decarboxylase family protein  38.93 
 
 
280 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3056  hydratase/decarboxylase family protein  35.09 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2075  hydratase/decarboxylase family protein  34.96 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488863  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.64 
 
 
256 aa  106  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.29 
 
 
254 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  33.07 
 
 
261 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  30.77 
 
 
266 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2038  putative hydratase  30.68 
 
 
268 aa  89.4  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  31.76 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.45 
 
 
257 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.04 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  30.74 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  32.55 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  31.78 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.2 
 
 
265 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  32.4 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1767  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  27.71 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  28.46 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2258  putative hydratase/decarboxylase  32.43 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0643634  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6716  hypothetical protein  29.67 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.57 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.08 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5815  hypothetical protein  29.26 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.23 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2908  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  27.49 
 
 
252 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  29.38 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.06 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  27.24 
 
 
281 aa  65.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.2 
 
 
280 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.61 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.38 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2652  hydratase/decarboxylase  28.45 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3930  hydratase/decarboxylase  31.42 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0554783  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2420  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.52 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.06 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.04 
 
 
269 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3044  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  25.94 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.04 
 
 
269 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.25 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3153  hydratase/decarboxylase  29.34 
 
 
261 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.59 
 
 
269 aa  62  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.59 
 
 
269 aa  62  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  29.64 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5145  putative hydratase  27.68 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0494321  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.65 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  29.64 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.2 
 
 
269 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2159  hydratase/decarboxylase  28.02 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0650  putative hydratase  28.05 
 
 
252 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.64 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.79 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5040  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.57 
 
 
260 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444899  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.12 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.7 
 
 
268 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3129  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.49 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159572  normal  0.889794 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3885  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.1 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3592  hydratase/decarboxylase  28.85 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal  0.0625876 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04226  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  31.48 
 
 
267 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3457  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.43 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4580  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.48 
 
 
267 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04192  hypothetical protein  31.48 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3706  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.48 
 
 
267 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3446  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.61 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.92 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1169  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.48 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135295  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1180  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.48 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.850117  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1215  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.48 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.033694  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1200  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.48 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1064  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.48 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.2 
 
 
269 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0240  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.81 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1671  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.19 
 
 
289 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.444038  normal  0.899188 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.71 
 
 
266 aa  56.2  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.02 
 
 
288 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1787  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.4 
 
 
267 aa  55.8  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.995557  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  30 
 
 
255 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2889  hydratase/decarboxylase  31.87 
 
 
169 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.09 
 
 
268 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0200  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.57 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.428998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>