227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2148 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  100 
 
 		 266 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  46.4 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  33.6 
 
 		 254 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  32.39 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.42 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  35.62 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  34.15 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  33.2 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.73 
 
 		 254 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  33.74 
 
 		 254 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  30.77 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.77 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.77 
 
 		 253 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.92 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.77 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  29.8 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.36 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.2 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.63 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5145  putative hydratase  29.96 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0494321  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  26.46 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  32.02 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5798  hydratase/decarboxylase family protein  29.88 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000214426  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  33.94 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0561  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  31.37 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.12 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.12 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  27.45 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.26 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.84 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.96 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.48 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  26.07 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.81 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.96 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5795  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.48 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.13 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.78 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.02 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1767  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  28.63 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.27 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.14 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.18 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.18 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3930  hydratase/decarboxylase  33.06 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0554783  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  31.35 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  31.33 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.68 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  27.56 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.97 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.63 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  27.56 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  27.56 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  29.17 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  27.56 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.19 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  28.52 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.53 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270652 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  27.11 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.11 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  27.73 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.55 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3428  hydratase/decarboxylase family protein  27.37 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.14 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  27.11 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.61 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3602  hydratase/decarboxylase family protein  27.9 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  30 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  30.97 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.63 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.95 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.06 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0577  hydratase/decarboxylase family protein  28.12 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.74 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.74 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.56 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  27.4 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.84 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  26.38 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.27 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.63 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.76 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0548  hydratase/decarboxylase family protein  27.45 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  26.46 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0633  hydratase/decarboxylase family protein  27.27 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  29.44 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  29.7 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.25 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2159  hydratase/decarboxylase  28.16 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3446  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.84 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2033  putative 2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase(HpaH)  27.38 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25595  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.67 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.24 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.58 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.58 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3851  hydratase/decarboxylase  29.89 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0976371  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.69 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0212  hypothetical protein  29.96 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0572  hydratase/decarboxylase family protein  28 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  28 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>