112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5145 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5145  putative hydratase  100 
 
 		 257 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0494321  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0561  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  64.26 
 
 		 256 aa  297  9e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2908  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  54.44 
 
 		 252 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0212  hypothetical protein  49.43 
 
 		 272 aa  221  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0650  putative hydratase  45.35 
 
 		 252 aa  197  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3446  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  46.99 
 
 		 276 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  36.79 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  31.49 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3930  hydratase/decarboxylase  36.28 
 
 		 238 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0554783  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.27 
 
 		 257 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  29.96 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.88 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  26.69 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  27.49 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  27.41 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.87 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2258  putative hydratase/decarboxylase  27.84 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0643634  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  29.91 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  28.57 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.52 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.4 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.68 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  28.57 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  28.57 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  27.68 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  26.79 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  31.06 
 
 		 263 aa  62  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  27.68 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.83 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0344  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.57 
 
 		 147 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713008 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  28.82 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  27.61 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.93 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1790  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.74 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0308919  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  28.29 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  27.91 
 
 		 366 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  27.44 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  26.81 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0577  hydratase/decarboxylase family protein  22.57 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.3 
 
 		 274 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.3 
 
 		 274 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0633  hydratase/decarboxylase family protein  23.14 
 
 		 268 aa  52  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  30.86 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.91 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  31 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.82 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3056  hydratase/decarboxylase family protein  25 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2504  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.62 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.99 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0548  hydratase/decarboxylase family protein  22.12 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5928  hydratase/decarboxylase  28.16 
 
 		 268 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.93 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  30.19 
 
 		 283 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.64 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.37 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.44 
 
 		 268 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  27.72 
 
 		 273 aa  48.9  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0572  hydratase/decarboxylase family protein  22.12 
 
 		 267 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.41 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.84 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.57 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3762  hydratase/decarboxylase family protein  22.12 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.35 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.38 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.54 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.48 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  23.17 
 
 		 261 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2033  putative 2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase(HpaH)  27.38 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25595  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  23.91 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  21.55 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.1 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.82 
 
 		 260 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3602  hydratase/decarboxylase family protein  22.47 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.14 
 
 		 262 aa  45.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.19 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.5 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1476  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.19 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  28.82 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  24.03 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.16 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.78 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  28.57 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  29.29 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.11 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.51 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.34 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.92 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.92 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1767  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  25 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.92 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.92 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.51 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.94 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0524  hydratase/decarboxylase family protein  21.3 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3885  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.34 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1406  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.97 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3428  hydratase/decarboxylase family protein  21.21 
 
 		 280 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.5 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  31.94 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.31 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>