72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0561 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0561  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  100 
 
 		 256 aa  508  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5145  putative hydratase  64.26 
 
 		 257 aa  297  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0494321  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2908  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  55.33 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0212  hypothetical protein  50.37 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0650  putative hydratase  44.88 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3446  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  47.39 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  38.91 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.5 
 
 		 260 aa  85.1  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  29.8 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  31.37 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.92 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.7 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  27.78 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3930  hydratase/decarboxylase  34.23 
 
 		 238 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0554783  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.38 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.46 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  29.7 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2258  putative hydratase/decarboxylase  30.2 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0643634  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.6 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.31 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.1 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.96 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2075  hydratase/decarboxylase family protein  22.22 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488863  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.42 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  28.03 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.75 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.7 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.67 
 
 		 266 aa  48.5  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  25.9 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  25.9 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.51 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  24.37 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.96 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  25.9 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  24.58 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.67 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.74 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3056  hydratase/decarboxylase family protein  24.24 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  28.29 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.11 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  30.63 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0548  hydratase/decarboxylase family protein  22.47 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1476  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  24.61 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3897  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  23.98 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0577  hydratase/decarboxylase family protein  22.47 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3947  hydratase/decarboxylase  23.98 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  hitchhiker  0.00797291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3762  hydratase/decarboxylase family protein  22.47 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.24 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.93 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.19 
 
 		 288 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  25.77 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.06 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0572  hydratase/decarboxylase family protein  22.47 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.22 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.28 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  24 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  26.87 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  23.33 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  24.31 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3885  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  23.65 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  32.48 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  25.61 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5815  hypothetical protein  26.62 
 
 		 252 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.38 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.52 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.52 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.26 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  28.93 
 
 		 263 aa  42.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.32 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0524  hydratase/decarboxylase family protein  23.11 
 
 		 280 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.63 
 
 		 264 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.65 
 
 		 260 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>