72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3446 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3446  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  100 
 
 		 276 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2908  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  50.2 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0561  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  47.39 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0650  putative hydratase  47.76 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5145  putative hydratase  46.99 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0494321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0212  hypothetical protein  43.07 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  33.08 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  33.06 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  31.82 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.64 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3930  hydratase/decarboxylase  34.68 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0554783  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  31.05 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.31 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  31.02 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  29.84 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2258  putative hydratase/decarboxylase  33.06 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0643634  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.54 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.52 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  29.44 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  34.73 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  30.61 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.61 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.61 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.61 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.68 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.08 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  29.92 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  30.17 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  31.52 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.95 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.21 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  29.8 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.58 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.43 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  31.01 
 
 		 366 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  31.01 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.8 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.13 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.39 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.39 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.7 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1790  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.39 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0308919  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  31.01 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.9 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1076  hydratase/decarboxylase  25.52 
 
 		 260 aa  49.3  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0633702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  32.79 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.91 
 
 		 269 aa  48.9  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.31 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.54 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  26.38 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.23 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  28.09 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.58 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  29.7 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.4 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.1 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2504  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.8 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.65 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.55 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  32 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  32.72 
 
 		 264 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.08 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.83 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.25 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.65 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  30.86 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  30.77 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9112  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.57 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00080  conserved hypothetical protein  29.05 
 
 		 387 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.94 
 
 		 254 aa  42.7  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.19 
 
 		 263 aa  42.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>