193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6957 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  100 
 
 		 249 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  71.66 
 
 		 257 aa  362  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  60.08 
 
 		 254 aa  290  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  47.37 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  44.53 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2258  putative hydratase/decarboxylase  44.53 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0643634  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.22 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.97 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3930  hydratase/decarboxylase  36.44 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0554783  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  33.63 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.39 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5145  putative hydratase  31.49 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0494321  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  32.63 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.63 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.63 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.78 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5795  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.09 
 
 		 267 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2908  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  28.46 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  33.02 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.2 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  30.93 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  31.58 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  32.02 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  32.02 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5798  hydratase/decarboxylase family protein  29.52 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000214426  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0561  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  29.69 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0650  putative hydratase  29.31 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  29.17 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  25.63 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0633  hydratase/decarboxylase family protein  28.38 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  31.43 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.94 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  31.84 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3602  hydratase/decarboxylase family protein  29.18 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1182  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.52 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  30.84 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0577  hydratase/decarboxylase family protein  29 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0212  hypothetical protein  29 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3428  hydratase/decarboxylase family protein  31.1 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0548  hydratase/decarboxylase family protein  27.95 
 
 		 267 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.3 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.72 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3762  hydratase/decarboxylase family protein  28.57 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0572  hydratase/decarboxylase family protein  28.14 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0524  hydratase/decarboxylase family protein  30.62 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3044  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  27.2 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.2 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.26 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  28.23 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2652  hydratase/decarboxylase  28.33 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.82 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.5 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3592  hydratase/decarboxylase  28.44 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.24 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3446  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.68 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.46 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2075  hydratase/decarboxylase family protein  28.05 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488863  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.46 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3153  hydratase/decarboxylase  28.57 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  31.65 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2159  hydratase/decarboxylase  27.9 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.08 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.08 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1904  hydratase/decarboxylase  23.56 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9112  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.27 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.95 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  26.05 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  25.48 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3511  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  25.19 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  26.96 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3056  hydratase/decarboxylase family protein  30.99 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.09 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.97 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.67 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.86 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1476  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.69 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.39 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  25.57 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.05 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.45 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.76 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.07 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.67 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.71 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1708  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.05 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.899066  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.8 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.29 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2038  putative hydratase  32.41 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1165  putative hydratase protein  25.65 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3129  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.43 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159572  normal  0.889794 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  25.96 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1767  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  22.51 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.62 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.35 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.35 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.29 
 
 		 267 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.78 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.07 
 
 		 279 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.13 
 
 		 260 aa  52  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.04 
 
 		 263 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>