153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2258 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2258  putative hydratase/decarboxylase  100 
 
 		 253 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0643634  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  91.7 
 
 		 253 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  78.66 
 
 		 253 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  45.02 
 
 		 257 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  44.53 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  44.4 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.5 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  35 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.15 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  34.21 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3930  hydratase/decarboxylase  35.71 
 
 		 238 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0554783  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  34.8 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  34.51 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  31.05 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  35.61 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  34.8 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  34.8 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  34 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  33.73 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0561  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  30.2 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5145  putative hydratase  27.84 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0494321  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  32.3 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.33 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  34.82 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  34.41 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00080  conserved hypothetical protein  31.37 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  30.47 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2908  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.46 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  30.49 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3446  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  33.06 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.34 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1165  putative hydratase protein  29.96 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5798  hydratase/decarboxylase family protein  30.2 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000214426  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5795  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.76 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0633  hydratase/decarboxylase family protein  28.17 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0577  hydratase/decarboxylase family protein  27.59 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2075  hydratase/decarboxylase family protein  26.21 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0548  hydratase/decarboxylase family protein  27.45 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3762  hydratase/decarboxylase family protein  27.84 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0572  hydratase/decarboxylase family protein  27.59 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2038  putative hydratase  31.82 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0259  hydratase/decarboxylase  25.98 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000347099  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3044  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  28.35 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3056  hydratase/decarboxylase family protein  29.09 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3602  hydratase/decarboxylase family protein  28.11 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.64 
 
 		 279 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  27.53 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.43 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0650  putative hydratase  28.95 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  26.18 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3428  hydratase/decarboxylase family protein  25.54 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.17 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.78 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1790  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.99 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0308919  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0524  hydratase/decarboxylase family protein  25.11 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.33 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0212  hypothetical protein  26.02 
 
 		 272 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0061  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  22.3 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.18 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0344  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.12 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2889  hydratase/decarboxylase  26.79 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1904  hydratase/decarboxylase  23.55 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.39 
 
 		 274 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.43 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.57 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0237  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  25.66 
 
 		 311 aa  52.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.38 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1671  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.97 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.444038  normal  0.899188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.25 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.47 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6716  hypothetical protein  26.58 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.67 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.26 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.11 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.24 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1708  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.72 
 
 		 268 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.899066  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3129  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.28 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159572  normal  0.889794 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1767  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  24.48 
 
 		 271 aa  48.9  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  30 
 
 		 263 aa  48.5  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3457  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.5 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.45 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  25.71 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.65 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  27.73 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5040  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.51 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3997  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  27.33 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.88 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  23.35 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.25 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.31 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  28.47 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.85 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.67 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.17 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.34 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.89 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.1 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9112  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.1 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.86 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  26.99 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>