189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5795 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5795  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  100 
 
 
267 aa  526  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5798  hydratase/decarboxylase family protein  81.57 
 
 
269 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000214426  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  45.6 
 
 
254 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  46.15 
 
 
253 aa  185  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  46.64 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  46.25 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  45.34 
 
 
254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  45.85 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  45.85 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  45.85 
 
 
253 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0577  hydratase/decarboxylase family protein  42.46 
 
 
267 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0548  hydratase/decarboxylase family protein  42.46 
 
 
267 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  43.08 
 
 
366 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0633  hydratase/decarboxylase family protein  40.15 
 
 
268 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  43.08 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  42.69 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0572  hydratase/decarboxylase family protein  42.06 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3762  hydratase/decarboxylase family protein  41.67 
 
 
267 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  40.93 
 
 
274 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3428  hydratase/decarboxylase family protein  40.93 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0524  hydratase/decarboxylase family protein  40.93 
 
 
280 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3056  hydratase/decarboxylase family protein  37.7 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3602  hydratase/decarboxylase family protein  40.38 
 
 
271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2075  hydratase/decarboxylase family protein  33.33 
 
 
258 aa  116  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488863  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  32.61 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  30.2 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  29.92 
 
 
261 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  30.37 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  30.09 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.08 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.64 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  30.49 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  29.48 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.22 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.03 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5815  hypothetical protein  29.13 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.78 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0971  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.45 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0126306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  28.02 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.89 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.238552  normal  0.686193 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2038  putative hydratase  29.74 
 
 
268 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1158  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.42 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3129  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.83 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159572  normal  0.889794 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2504  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.62 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1476  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.54 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1061  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.77 
 
 
267 aa  62.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.47 
 
 
267 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.48 
 
 
265 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.04 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6716  hypothetical protein  27.7 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.74 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2420  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.86 
 
 
278 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2258  putative hydratase/decarboxylase  28.79 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0643634  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0237  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  26.69 
 
 
311 aa  59.7  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1767  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  24.8 
 
 
271 aa  58.9  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.63 
 
 
275 aa  58.9  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5928  hydratase/decarboxylase  29.39 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  25.88 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.73 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.12 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.46 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.68 
 
 
274 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  27.23 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0650  putative hydratase  30.13 
 
 
252 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.52 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3153  hydratase/decarboxylase  27.86 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.92 
 
 
280 aa  55.8  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  29.06 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.91 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.23 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3658  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.41 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.98 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.86 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4132  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.41 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138195  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2410  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.74 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149257  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.41 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.41 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.98 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  26.32 
 
 
263 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  26.32 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2652  hydratase/decarboxylase  25.61 
 
 
261 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3457  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.65 
 
 
260 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.94 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.57 
 
 
269 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1730  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.24 
 
 
267 aa  52.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  29.9 
 
 
269 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3281  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.41 
 
 
267 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0269586  normal  0.185525 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1778  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.41 
 
 
267 aa  52.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4130  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.41 
 
 
267 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4236  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.41 
 
 
267 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119671  normal  0.0833029 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  29.9 
 
 
269 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  28.3 
 
 
265 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  29.44 
 
 
263 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  26.86 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.9 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1955  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.94 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504182  normal  0.0219036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.05 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1708  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.74 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.899066  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  27.07 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4369  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.17 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455554  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>