51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0237 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0237  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  100 
 
 
311 aa  618  1e-176  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1767  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  48.21 
 
 
271 aa  213  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3044  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  40.84 
 
 
260 aa  196  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3511  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  41.04 
 
 
269 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  38.91 
 
 
281 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0262  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  64.55 
 
 
110 aa  146  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01499  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  33 
 
 
482 aa  112  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3592  hydratase/decarboxylase  29.69 
 
 
260 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0200  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  26.38 
 
 
260 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.428998  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5798  hydratase/decarboxylase family protein  26.95 
 
 
269 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000214426  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5795  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  26.69 
 
 
267 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  25.75 
 
 
253 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  26.89 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  26.89 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  26.89 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  25.32 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  24.15 
 
 
261 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0577  hydratase/decarboxylase family protein  24.55 
 
 
267 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  27.44 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.13 
 
 
275 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  27.86 
 
 
254 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  25.51 
 
 
265 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0572  hydratase/decarboxylase family protein  24.28 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0548  hydratase/decarboxylase family protein  23.91 
 
 
267 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  25.22 
 
 
266 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  26.98 
 
 
254 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3428  hydratase/decarboxylase family protein  22.41 
 
 
280 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  23.66 
 
 
261 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  25.47 
 
 
253 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3762  hydratase/decarboxylase family protein  24.28 
 
 
267 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3602  hydratase/decarboxylase family protein  25.89 
 
 
271 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  24.89 
 
 
253 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0524  hydratase/decarboxylase family protein  22.41 
 
 
280 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0633  hydratase/decarboxylase family protein  22.22 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  27.72 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  27.08 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  25.77 
 
 
366 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  22.41 
 
 
274 aa  46.6  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  22.99 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.03 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2652  hydratase/decarboxylase  26.98 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.1 
 
 
261 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.74 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  25.48 
 
 
254 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1076  hydratase/decarboxylase  25.93 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0633702  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2159  hydratase/decarboxylase  27.24 
 
 
261 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.75 
 
 
260 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.39 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  27.36 
 
 
264 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  26.15 
 
 
254 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2258  putative hydratase/decarboxylase  25.28 
 
 
253 aa  42.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0643634  normal  0.693124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>