17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01499 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01499  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  100 
 
 		 482 aa  976    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1767  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  32.52 
 
 		 271 aa  117  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0237  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  33 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3044  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  34.17 
 
 		 260 aa  107  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3511  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.18 
 
 		 269 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.76 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.68 
 
 		 257 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.52 
 
 		 260 aa  53.9  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0262  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  30.61 
 
 		 110 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3083  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 541 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186488  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0200  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  24.56 
 
 		 260 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.428998  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 541 aa  47.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  24.38 
 
 		 266 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  24.77 
 
 		 254 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 		 1211 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00080  conserved hypothetical protein  24.15 
 
 		 387 aa  43.9  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  21.52 
 
 		 264 aa  43.1  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>