88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3511 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3511  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  100 
 
 		 269 aa  528  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3044  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  51.56 
 
 		 260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0237  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  41.04 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  40.08 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1767  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  37.69 
 
 		 271 aa  148  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01499  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  32.18 
 
 		 482 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.74 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0262  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  36.63 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  29.73 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  25.59 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.58 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  26.77 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.29 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.95 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.19 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  31.62 
 
 		 261 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  29.39 
 
 		 366 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0200  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.67 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.428998  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.06 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.07 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  27.69 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.82 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.79 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.25 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  25.19 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.55 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3592  hydratase/decarboxylase  29.07 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  29.01 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  26.41 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.55 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.23 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  28.24 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  27.86 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.93 
 
 		 265 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.07 
 
 		 264 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.45 
 
 		 268 aa  48.9  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.02 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.64 
 
 		 262 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.73 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  26.3 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  26.3 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  25.75 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  25.75 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  24.81 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.21 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  24.16 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.24 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  27.91 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  25.75 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0876  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.13 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355708 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  25.75 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  28.05 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  25.75 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.07 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  25.75 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.63 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.41 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.5 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  25.19 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.75 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  27.4 
 
 		 268 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  25.19 
 
 		 253 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.74 
 
 		 280 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5826  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  25.57 
 
 		 256 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242898  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  28.76 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  21.79 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  28 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.89 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  28.63 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.52 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5798  hydratase/decarboxylase family protein  26.64 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000214426  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  23.02 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  25.66 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.51 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.36 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.35 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.63 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4279  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.16 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00917502  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1708  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.85 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.899066  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  28.07 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.52 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.51 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  25.75 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  27.23 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.19 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1165  putative hydratase protein  27.97 
 
 		 251 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.63 
 
 		 260 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.63 
 
 		 260 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>