231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1455 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  99.61 
 
 
366 aa  493  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  100 
 
 
254 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  98.82 
 
 
254 aa  487  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  85.83 
 
 
254 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  70.47 
 
 
253 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  70.47 
 
 
253 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  70.08 
 
 
253 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  68.9 
 
 
253 aa  348  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  68.9 
 
 
254 aa  347  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  68.9 
 
 
253 aa  345  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  67.32 
 
 
253 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0577  hydratase/decarboxylase family protein  41.34 
 
 
267 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3428  hydratase/decarboxylase family protein  40.31 
 
 
280 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  40.15 
 
 
274 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0633  hydratase/decarboxylase family protein  39.85 
 
 
268 aa  185  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0524  hydratase/decarboxylase family protein  39.92 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3762  hydratase/decarboxylase family protein  40.55 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0548  hydratase/decarboxylase family protein  40.16 
 
 
267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5798  hydratase/decarboxylase family protein  43.82 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000214426  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0572  hydratase/decarboxylase family protein  40.16 
 
 
267 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3602  hydratase/decarboxylase family protein  39.62 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5795  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  42.69 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3056  hydratase/decarboxylase family protein  33.86 
 
 
271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2075  hydratase/decarboxylase family protein  34.96 
 
 
258 aa  125  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488863  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  33.74 
 
 
266 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  35.86 
 
 
261 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.4 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  32.77 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.76 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.09 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  32.02 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  31.92 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  33.94 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.55 
 
 
265 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  33.19 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2038  putative hydratase  29.2 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.31 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.18 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2159  hydratase/decarboxylase  29.61 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2258  putative hydratase/decarboxylase  32.93 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0643634  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  32.02 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5815  hypothetical protein  27.98 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.73 
 
 
261 aa  72  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6716  hypothetical protein  28.71 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.33 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3153  hydratase/decarboxylase  29.57 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2652  hydratase/decarboxylase  29.18 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.88 
 
 
264 aa  68.6  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  28.63 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.11 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.46 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1767  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  24.8 
 
 
271 aa  62.4  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.08 
 
 
280 aa  62  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1671  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.79 
 
 
289 aa  62  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.444038  normal  0.899188 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1904  hydratase/decarboxylase  28.05 
 
 
270 aa  62  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  28.81 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.93 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3592  hydratase/decarboxylase  32.55 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3930  hydratase/decarboxylase  32.91 
 
 
238 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0554783  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.89 
 
 
260 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3457  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.98 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.7 
 
 
264 aa  59.3  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.68 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.33 
 
 
259 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.25 
 
 
269 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.25 
 
 
269 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.66 
 
 
262 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0200  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.28 
 
 
260 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.428998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.25 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.25 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4284  hydratase/decarboxylase  30.42 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.63 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.63 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.19 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  35.34 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  30.63 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.74 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.238552  normal  0.686193 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.3 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.06 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.87 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  32.5 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1158  2-keto-4-pentenoate hydratase  29.65 
 
 
267 aa  56.2  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0101  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.18 
 
 
277 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3524  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.63 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.26 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  24.32 
 
 
255 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1061  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.65 
 
 
267 aa  55.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  30 
 
 
269 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4208  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.56 
 
 
261 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  31.25 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.57 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5145  putative hydratase  27.44 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0494321  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8638  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.98 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423963  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2420  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.34 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.49 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  27 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5040  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.49 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444899  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.52 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.8 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2889  hydratase/decarboxylase  30.38 
 
 
169 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>