138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2133 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  100 
 
 		 261 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  46.4 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  34.4 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  34.4 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  34.65 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  33.6 
 
 		 253 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  33.07 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  33.6 
 
 		 253 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  33.6 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  35.86 
 
 		 366 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  35.86 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.28 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  33.2 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.18 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  35.44 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  33.61 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5798  hydratase/decarboxylase family protein  29.53 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000214426  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  31.13 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.92 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5795  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.92 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0633  hydratase/decarboxylase family protein  29 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  29.02 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3762  hydratase/decarboxylase family protein  29.45 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0577  hydratase/decarboxylase family protein  29.1 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3428  hydratase/decarboxylase family protein  29.13 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  31.54 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0548  hydratase/decarboxylase family protein  29.1 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0572  hydratase/decarboxylase family protein  29.48 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  28.35 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0524  hydratase/decarboxylase family protein  27.8 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.51 
 
 		 281 aa  72  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.49 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3602  hydratase/decarboxylase family protein  27.97 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2258  putative hydratase/decarboxylase  29.3 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0643634  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.31 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  27.09 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  30.92 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  28.23 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  29.5 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2075  hydratase/decarboxylase family protein  25.6 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488863  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.86 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1767  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  26.15 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.92 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.12 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1790  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.61 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0308919  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.15 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.14 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.6 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  26.72 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5145  putative hydratase  28.29 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0494321  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.84 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.84 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3056  hydratase/decarboxylase family protein  25.29 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.87 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.97 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2038  putative hydratase  29.27 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.42 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0212  hypothetical protein  28.83 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  26.69 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  25.56 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2908  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  26.69 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.37 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.95 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3930  hydratase/decarboxylase  31.9 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0554783  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.75 
 
 		 274 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.75 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2504  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.63 
 
 		 266 aa  52.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  31.85 
 
 		 262 aa  52  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  32.05 
 
 		 273 aa  52  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0561  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  28.03 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.54 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.85 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  31.21 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0650  putative hydratase  29.07 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3044  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  26.62 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.26 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.54 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.82 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1165  putative hydratase protein  26.27 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  25.38 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0237  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  23.66 
 
 		 311 aa  50.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.14 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.72 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3511  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.01 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.08 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3592  hydratase/decarboxylase  32.27 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  29.61 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  24.06 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1150  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.08 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.44 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.44 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04226  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  24.62 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5085  hydratase/decarboxylase family protein  31.96 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3446  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.7 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.77 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.32 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4580  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  24.62 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2889  hydratase/decarboxylase  29.48 
 
 		 169 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  24.05 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2456  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  23.4 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>