40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6716 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6716  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5815  hypothetical protein  85.32 
 
 		 252 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.85 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  30.13 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.13 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.13 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  29.39 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.67 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3428  hydratase/decarboxylase family protein  29.58 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0524  hydratase/decarboxylase family protein  29.11 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  28.71 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  28.71 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  28.71 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.7 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  29.58 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3602  hydratase/decarboxylase family protein  29.46 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  27.8 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0548  hydratase/decarboxylase family protein  27.99 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0572  hydratase/decarboxylase family protein  28.88 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0577  hydratase/decarboxylase family protein  28.88 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5798  hydratase/decarboxylase family protein  27.45 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000214426  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3762  hydratase/decarboxylase family protein  27.27 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5795  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  27.7 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.64 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0633  hydratase/decarboxylase family protein  27.49 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  29.87 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  28.08 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2652  hydratase/decarboxylase  30.64 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2159  hydratase/decarboxylase  30.64 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3056  hydratase/decarboxylase family protein  29.31 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.05 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  26.5 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3153  hydratase/decarboxylase  30.21 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0212  hypothetical protein  28.47 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2075  hydratase/decarboxylase family protein  24.8 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488863  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  23.89 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  26.38 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  25.38 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  28 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.73 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>