228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1513 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1513  hydratase/decarboxylase  100 
 
 
280 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0408  putative decarboxylase  48.18 
 
 
276 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1050  hydratase/decarboxylase  46.05 
 
 
284 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326912  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4067  hydratase/decarboxylase  44.03 
 
 
285 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.62 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5210  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.26 
 
 
254 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.39218  normal  0.210604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1406  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.1 
 
 
261 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0912  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.96 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.704461  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.79 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.69 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  28.7 
 
 
262 aa  82  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.5 
 
 
260 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  29.92 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.94 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  28.09 
 
 
283 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  29.64 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.17 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.84 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.49 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  27.63 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.84 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.11 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  27.69 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5500  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.7 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.69 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.96 
 
 
260 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3521  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.82 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.87 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.59 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.87 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.69 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  30 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.51 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1064  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.97 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4284  hydratase/decarboxylase  31.08 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.59 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  30.52 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.59 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  27.34 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  31.73 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.2 
 
 
260 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1180  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.59 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.850117  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1169  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.59 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135295  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.2 
 
 
260 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1215  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.59 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.033694  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.44 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1200  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.59 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.88 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.41 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.22 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.22 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.8 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.24 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.05 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.57 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  26.22 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.22 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.96 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.84 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.22 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0240  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.35 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.57 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.62 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  26.82 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.53 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.38 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.53 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5137  hydratase/decarboxylase  28.38 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.838757  normal  0.0331511 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.39 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04226  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  26.82 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.75 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3706  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.82 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4580  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.82 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.01 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  29.49 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.25 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.09 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04192  hypothetical protein  26.82 
 
 
273 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.07 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.41 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  27.93 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.34 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.99 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3524  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.92 
 
 
257 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3851  hydratase/decarboxylase  26.27 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0976371  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.68 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0630  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.24 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.337949  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.88 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  28.46 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  24.71 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.78 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  27 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.72 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.41 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.13 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  27.93 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7643  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.78 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.02 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.15 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2784  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.08 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.191345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>