More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1580 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1580  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 396 aa  797    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0121  RND family efflux transporter MFP subunit  33.2 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000605752  hitchhiker  0.000000000000341036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  35.61 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0141  membrane fusion protein  27.74 
 
 		 317 aa  101  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  34.63 
 
 		 382 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  33.66 
 
 		 406 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  33.5 
 
 		 394 aa  96.3  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  31.84 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  30.1 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  28.89 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  23.69 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  29.85 
 
 		 377 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1637  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.85 
 
 		 377 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.85 
 
 		 377 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.15 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.15 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  28.79 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  30.3 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  23.42 
 
 		 358 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  23.14 
 
 		 354 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1023  RND family efflux transporter MFP subunit  27.19 
 
 		 378 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.866452  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  32.02 
 
 		 392 aa  86.7  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.48 
 
 		 397 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  26.83 
 
 		 365 aa  86.7  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  23.26 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  23.14 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.16 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  27.04 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1119  RND family efflux transporter MFP subunit  22.84 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000371819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  31.4 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  30.81 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1737  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190652  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2846  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  23.48 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0776882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  28.92 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.95 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  28.93 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  28.93 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  28.93 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  28.79 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  30.05 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  23.1 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.27 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  26.96 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_004310  BR1089  hypothetical protein  29.17 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  21.83 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2428  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00201655  decreased coverage  0.00000151053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  23.66 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  27.81 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000248395  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  29.41 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.49 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  25.13 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  28.22 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  26.87 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.43 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4015  hypothetical protein  25.23 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  26.87 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 355 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  27.23 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.87 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  29.56 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  26.63 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  25.16 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  27.14 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2454  RND family efflux transporter MFP subunit  24.51 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.41 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  25.76 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.78 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  27.96 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  29.58 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  29.56 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.93 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000422764  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1050  hypothetical protein  28.7 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  30.85 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  31.02 
 
 		 561 aa  77.4  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0650  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.77 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  28.5 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3778  hypothetical protein  25.55 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.748326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  28.5 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01922  RND efflux membrane fusion protein  30.46 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.84 
 
 		 671 aa  76.3  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.09 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  28.88 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2074  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  26.11 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  29.38 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  28.88 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.45 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  26.24 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.78 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  26.37 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.13 
 
 		 368 aa  76.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0979  transporter, putative  26.4 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  27.8 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1389  HlyD family secretion protein  26.47 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>