More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3116 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  98.86 
 
 		 450 aa  688    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 351 aa  698    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  98.86 
 
 		 416 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  98 
 
 		 416 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  98.86 
 
 		 416 aa  689    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  98.86 
 
 		 416 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  91.39 
 
 		 343 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  84.46 
 
 		 343 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  73.43 
 
 		 289 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  73.43 
 
 		 289 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  74.28 
 
 		 288 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  70.65 
 
 		 297 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  73.98 
 
 		 273 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  75.27 
 
 		 290 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  77.11 
 
 		 290 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  58.96 
 
 		 282 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  55.19 
 
 		 273 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 255 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  56.87 
 
 		 276 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  57.26 
 
 		 285 aa  281  9e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  56.49 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  47.79 
 
 		 274 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  55.28 
 
 		 269 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  51.43 
 
 		 278 aa  269  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  54.37 
 
 		 273 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  47.08 
 
 		 283 aa  261  1e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  50.74 
 
 		 272 aa  259  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  49.45 
 
 		 279 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  49.26 
 
 		 274 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  49.82 
 
 		 277 aa  250  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  49.63 
 
 		 280 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  53.26 
 
 		 256 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  50 
 
 		 275 aa  246  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  49.42 
 
 		 289 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  44.49 
 
 		 272 aa  238  1e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  50.55 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  41.79 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  44.98 
 
 		 350 aa  225  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  32.1 
 
 		 295 aa  102  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  31.23 
 
 		 251 aa  99.8  6e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  30.58 
 
 		 263 aa  96.3  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  29.61 
 
 		 274 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  31.3 
 
 		 245 aa  94  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  31.2 
 
 		 244 aa  93.2  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  32.28 
 
 		 251 aa  92.8  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  29.64 
 
 		 246 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  31.72 
 
 		 254 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  34.05 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  30.77 
 
 		 245 aa  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  34.22 
 
 		 269 aa  90.1  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  34.97 
 
 		 244 aa  89.7  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  32.97 
 
 		 279 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  27.82 
 
 		 249 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  28.62 
 
 		 289 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  32.97 
 
 		 279 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  28.31 
 
 		 244 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  35.45 
 
 		 247 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  34.92 
 
 		 248 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  32.11 
 
 		 270 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  31.2 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  32.26 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4181  NAD-dependent deacetylase  31.56 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000834887  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  26.69 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  28.34 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  31.22 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3685  NAD-dependent deacetylase  30.22 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209228  decreased coverage  0.000299877 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  29.14 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  27.72 
 
 		 267 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  35.67 
 
 		 236 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  32.07 
 
 		 249 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  32.39 
 
 		 242 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  27.37 
 
 		 241 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01782  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09210)  32.35 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  34.13 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  27.88 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  30.16 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  25.32 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21050  hypothetical protein  28.69 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  35.14 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1704  transcriptional regulator, Sir2 family  31.14 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  32.58 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  34.04 
 
 		 243 aa  79.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  30.3 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0653  hypothetical protein  27.39 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  33.52 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  24.19 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  29.35 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  29.57 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  28.57 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0675  hypothetical protein  25.7 
 
 		 285 aa  75.9  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  23.95 
 
 		 237 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  32.37 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  29.31 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  28.9 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62714  conserved hypothetical protein  24.37 
 
 		 583 aa  73.6  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  29.63 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  33.53 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  33.53 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>