More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0813 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 297 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  95.6 
 
 		 273 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  87.21 
 
 		 289 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  88.11 
 
 		 288 aa  507  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  87.21 
 
 		 289 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  86.05 
 
 		 290 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  83.73 
 
 		 290 aa  471  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  71.68 
 
 		 343 aa  417  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  70.99 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  70.65 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  70.65 
 
 		 450 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  70.65 
 
 		 351 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  70.65 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  70.65 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  69.83 
 
 		 416 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  59.16 
 
 		 282 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  61.13 
 
 		 255 aa  306  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  57.41 
 
 		 273 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  61.16 
 
 		 269 aa  299  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  55.6 
 
 		 276 aa  288  6e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  57.65 
 
 		 285 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  57.74 
 
 		 271 aa  276  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  49.44 
 
 		 274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  52.77 
 
 		 278 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  51.84 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  55.34 
 
 		 273 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  51.87 
 
 		 274 aa  258  8e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  54.47 
 
 		 279 aa  258  9e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  55.16 
 
 		 256 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  50.56 
 
 		 277 aa  248  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  49.82 
 
 		 280 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  48.39 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  50.98 
 
 		 289 aa  244  9e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  40.65 
 
 		 275 aa  226  4e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  51.77 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  43.63 
 
 		 272 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  43.87 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  32.39 
 
 		 295 aa  105  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  31.5 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  30.08 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  33.47 
 
 		 244 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  34.41 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  32.23 
 
 		 246 aa  100  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  31.85 
 
 		 249 aa  99  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  28.73 
 
 		 249 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  31.67 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  35.91 
 
 		 256 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  30.47 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  30.82 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  29.52 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  27.57 
 
 		 245 aa  94  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  31.05 
 
 		 263 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  31.05 
 
 		 244 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  32.09 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  31.82 
 
 		 248 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  30.3 
 
 		 260 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  28.69 
 
 		 249 aa  89.7  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  32.43 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  29.85 
 
 		 242 aa  89.4  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  32.44 
 
 		 257 aa  89  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  28.85 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  30.71 
 
 		 251 aa  87.4  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  28.03 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  31.82 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  28.41 
 
 		 252 aa  86.3  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 262 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  25.21 
 
 		 287 aa  85.5  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  32.33 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  28.24 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  30.92 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  30.68 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  31.73 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  29.41 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  28.51 
 
 		 612 aa  83.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  28.4 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  25.3 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  33.09 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  27.84 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  31.07 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  29.74 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  27.5 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  31.2 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  29.74 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  29.28 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00950  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  29.82 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0748135  normal  0.482885 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  34.1 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  25.27 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  25.27 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  29.74 
 
 		 246 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  29.34 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  26.47 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  30.12 
 
 		 233 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  32.45 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01782  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09210)  32.85 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1453  NAD-dependent deacetylase  26.16 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0321606  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  30.71 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  26.14 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>