More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0803 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 273 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  95.6 
 
 		 297 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  90.11 
 
 		 288 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  89.74 
 
 		 289 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  89.74 
 
 		 289 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  88.63 
 
 		 290 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  89.56 
 
 		 290 aa  461  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  74.35 
 
 		 343 aa  408  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  74.35 
 
 		 343 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  73.98 
 
 		 416 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  73.98 
 
 		 416 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  73.98 
 
 		 416 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  73.98 
 
 		 450 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  73.98 
 
 		 351 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  73.43 
 
 		 416 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  56.93 
 
 		 282 aa  305  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  60.32 
 
 		 255 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  56.39 
 
 		 273 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  58.08 
 
 		 269 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  56.09 
 
 		 285 aa  281  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  53.73 
 
 		 276 aa  279  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  48.52 
 
 		 274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  57.74 
 
 		 271 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  51.29 
 
 		 278 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  51.1 
 
 		 272 aa  264  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  55.34 
 
 		 273 aa  262  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  51.49 
 
 		 274 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  53.41 
 
 		 279 aa  255  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  55.29 
 
 		 256 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 275 aa  249  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  51.37 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  50.18 
 
 		 280 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  50.43 
 
 		 283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  50.56 
 
 		 277 aa  244  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  40.82 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  42.75 
 
 		 272 aa  215  5.9999999999999996e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  50.44 
 
 		 280 aa  215  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  42.42 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  35.71 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  31.6 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  30.83 
 
 		 295 aa  98.6  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  31.37 
 
 		 251 aa  98.6  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  34.59 
 
 		 244 aa  97.8  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  28.35 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  31.7 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  32.22 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  28.04 
 
 		 245 aa  95.5  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  31.18 
 
 		 246 aa  95.5  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  31.54 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  32.64 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  28.94 
 
 		 274 aa  93.6  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  34.81 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  30.65 
 
 		 263 aa  92.4  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  31.72 
 
 		 242 aa  90.5  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  28.69 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 262 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  32.23 
 
 		 248 aa  89  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  32.44 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  34.05 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  30 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  30.94 
 
 		 243 aa  86.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  30.65 
 
 		 284 aa  85.9  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  27.59 
 
 		 252 aa  85.5  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  34.59 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  34.46 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  30.11 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  28.33 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  29.46 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  29.37 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  30.04 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  29.34 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  31.44 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  30.04 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  35.59 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  27.59 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  30.17 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  28.99 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  28.33 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  30.04 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  24.5 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  28.1 
 
 		 612 aa  79.7  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  25.51 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  25.51 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  24.79 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  31.91 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  28.02 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  28.38 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  32.9 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  28.92 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  26.14 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01782  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09210)  32.39 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  30.63 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  35.39 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  31.07 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  26.45 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  29.72 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  30.4 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  28.11 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  27.9 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>