More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1096 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 
245 aa  505  9.999999999999999e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  62.08 
 
 
247 aa  322  4e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  56.79 
 
 
257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  52.79 
 
 
231 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  51.02 
 
 
254 aa  235  6e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  48.36 
 
 
269 aa  228  5e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  46.72 
 
 
253 aa  224  7e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  46.94 
 
 
251 aa  223  3e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  46.09 
 
 
251 aa  221  9e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  49.79 
 
 
250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  43.95 
 
 
246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  45.73 
 
 
234 aa  206  4e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  46.05 
 
 
242 aa  204  9e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  45.41 
 
 
254 aa  202  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  38.58 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  44.78 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  43.22 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  44.3 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  44.84 
 
 
244 aa  193  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  44.84 
 
 
244 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  46.5 
 
 
252 aa  192  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  46.55 
 
 
248 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2682  Silent information regulator protein Sir2  39.93 
 
 
271 aa  191  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  46.12 
 
 
251 aa  191  7e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  42.86 
 
 
242 aa  185  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  45.58 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  41.32 
 
 
243 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  43.81 
 
 
248 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  40.16 
 
 
252 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  42.42 
 
 
244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  43.42 
 
 
242 aa  178  7e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  43.22 
 
 
248 aa  178  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  42.62 
 
 
259 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  44.44 
 
 
249 aa  176  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  39.41 
 
 
237 aa  175  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  41.98 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  44.73 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  41.8 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  42.34 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  37.55 
 
 
256 aa  169  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  40.82 
 
 
245 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  39.74 
 
 
251 aa  169  5e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  43.11 
 
 
259 aa  168  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  43.36 
 
 
233 aa  168  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  40.59 
 
 
244 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  36.02 
 
 
273 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  41.84 
 
 
241 aa  166  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  39.43 
 
 
246 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0294  Silent information regulator protein Sir2  41.84 
 
 
249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  39.52 
 
 
256 aa  165  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  40 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  43.6 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  40.27 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  42.6 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  39.83 
 
 
237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  39.66 
 
 
237 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  39.66 
 
 
237 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  38.03 
 
 
243 aa  160  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  40.16 
 
 
266 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  40.6 
 
 
260 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2228  NAD-dependent deacetylase  42.26 
 
 
243 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2267  NAD-dependent deacetylase  42.26 
 
 
243 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  41.7 
 
 
247 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  41.44 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  39.57 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  38.78 
 
 
244 aa  155  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  39.57 
 
 
249 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  40.08 
 
 
246 aa  155  7e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  40.89 
 
 
248 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  41.33 
 
 
246 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  41.38 
 
 
253 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  42.31 
 
 
254 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  38.21 
 
 
253 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  39.42 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  40.76 
 
 
241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  36.14 
 
 
259 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  40.34 
 
 
256 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  38.56 
 
 
237 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  41.89 
 
 
247 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  39.91 
 
 
246 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1781  NAD-dependent deacetylase  37.55 
 
 
250 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  41.36 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  38.82 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  41.13 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0957  silent information regulator protein Sir2  38.84 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.925274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  39.92 
 
 
236 aa  145  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  37.56 
 
 
245 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  37.56 
 
 
245 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  40.42 
 
 
253 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  37.97 
 
 
262 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  41.38 
 
 
258 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  36.82 
 
 
242 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  38.53 
 
 
278 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  36.7 
 
 
241 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  37.56 
 
 
242 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  37.85 
 
 
238 aa  143  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  38.72 
 
 
253 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  38.82 
 
 
253 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  37.1 
 
 
242 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  35.34 
 
 
259 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>