More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2277 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  51.08 
 
 		 245 aa  255  4e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  49.54 
 
 		 244 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  49.54 
 
 		 244 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  44.16 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  40.32 
 
 		 254 aa  185  5e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  43.69 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  39.59 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  40.83 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  45.58 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  42.4 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  39.18 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  38.43 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  40.83 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  39.74 
 
 		 245 aa  169  5e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  37.19 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  36.86 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  36.78 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  42.25 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  39.59 
 
 		 278 aa  162  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  37.33 
 
 		 256 aa  161  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  39.66 
 
 		 234 aa  161  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  38.91 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  34.71 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  39.53 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  38.71 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  38.2 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  37.96 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  37.12 
 
 		 242 aa  158  9e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  41.01 
 
 		 248 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  36.89 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  35 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0957  silent information regulator protein Sir2  38.06 
 
 		 253 aa  156  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.925274  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0295  Silent information regulator protein Sir2  34.55 
 
 		 283 aa  155  7e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.216345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  36.65 
 
 		 256 aa  154  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  38.89 
 
 		 243 aa  154  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  38.91 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  37.71 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  38.4 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  38.6 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  40.55 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  36.29 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  37.22 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  36.03 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  36.29 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  38.46 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  34.24 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  36.02 
 
 		 253 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  36.33 
 
 		 256 aa  148  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  35.61 
 
 		 253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  35.89 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  39.47 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  36.17 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  35.8 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  36.18 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  36.4 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  37.04 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  34.87 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  35.43 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  36.44 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  35.47 
 
 		 259 aa  144  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1553  silent information regulator protein Sir2  36.13 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.469137  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  34.53 
 
 		 260 aa  141  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  36.6 
 
 		 245 aa  141  9e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  35.06 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  35.24 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  35.74 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  36.57 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  32.77 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  36.8 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  35.47 
 
 		 251 aa  138  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  38.2 
 
 		 244 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  34.18 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  34.53 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  36.2 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  34.47 
 
 		 251 aa  135  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  34.38 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3942  silent information regulator protein Sir2  31.75 
 
 		 292 aa  135  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.288967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  35.34 
 
 		 244 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  32.89 
 
 		 248 aa  135  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 268 aa  135  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994892 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07461  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05900)  34.85 
 
 		 361 aa  134  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.12277 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  32.65 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  34.96 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  34.05 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0528  Silent information regulator protein Sir2  32.01 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.02282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  34.05 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  34.05 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  35.19 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  34.05 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  33.74 
 
 		 273 aa  132  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  33.62 
 
 		 242 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  32.16 
 
 		 249 aa  131  7.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32025  putative histone deacetylase-like protein  38.1 
 
 		 326 aa  131  7.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.822239  normal  0.176883 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2228  NAD-dependent deacetylase  34.31 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  33.93 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2682  Silent information regulator protein Sir2  30.4 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2267  NAD-dependent deacetylase  34.31 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  33.92 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>