More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4173 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 256 aa  523  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  61.69 
 
 		 253 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  60.73 
 
 		 253 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  61.13 
 
 		 253 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  60.98 
 
 		 253 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4037  putative transciptional regulatory Sir2-family protein  61.75 
 
 		 253 aa  308  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.185162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  60.42 
 
 		 264 aa  301  8.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1553  silent information regulator protein Sir2  57.71 
 
 		 253 aa  291  7e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.469137  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  57.2 
 
 		 251 aa  288  7e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  44.17 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  45.49 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  42.28 
 
 		 266 aa  185  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  43.57 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  40.42 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  41.95 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  42.54 
 
 		 242 aa  175  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  42.15 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  41.33 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  38.66 
 
 		 241 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  38.14 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  38.89 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  36.59 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  39.91 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  39.91 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  41.23 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  35.59 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  34.8 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  40.27 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  39.51 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  40.53 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  36.67 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  40.53 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 251 aa  154  9e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  39.66 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  34.98 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  37.39 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  39.66 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  37.6 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  37.86 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  36.51 
 
 		 243 aa  151  8e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  40.34 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  34.84 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  36.36 
 
 		 244 aa  150  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  35.12 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  35.48 
 
 		 251 aa  149  6e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  36.48 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8749  silent information regulator protein Sir2  37.02 
 
 		 293 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  35.86 
 
 		 234 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  37.95 
 
 		 254 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2682  Silent information regulator protein Sir2  36.29 
 
 		 271 aa  144  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  35.04 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  40.25 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  33.21 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  32.63 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  37.97 
 
 		 251 aa  142  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3283  NAD-dependent deacetylase  34.66 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4678  NAD-dependent deacetylase  33.86 
 
 		 338 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3235  silent information regulator protein Sir2  34.25 
 
 		 309 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429904  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3799  NAD-dependent deacetylase  33.86 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  35.88 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  33.61 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  35.71 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  34.85 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2495  silent information regulator protein Sir2  35.56 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.479866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  34.29 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4322  Silent information regulator protein Sir2  35.85 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.0646385 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  35.25 
 
 		 275 aa  135  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3622  NAD-dependent deacetylase  34.26 
 
 		 304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  32.81 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4461  NAD-dependent deacetylase  34.26 
 
 		 362 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3905  NAD-dependent deacetylase  34.26 
 
 		 362 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  35.81 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2025  silent information regulator protein Sir2  31.25 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  36.82 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  30.89 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8513  Silent information regulator protein Sir2  34.92 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986574 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  33.89 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  35.68 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0265  silent information regulator protein Sir2  33.84 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  34.01 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  36.59 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0629  NAD-dependent deacetylase  35.1 
 
 		 311 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.289592  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  36.93 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  31.58 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2516  silent information regulator protein Sir2  35.08 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.201508  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  34.82 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0957  silent information regulator protein Sir2  39.55 
 
 		 253 aa  131  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.925274  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  33.07 
 
 		 345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5921  NAD-dependent deacetylase  32.96 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  36.96 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1962  Silent information regulator protein Sir2  34.26 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000762796  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2378  silent information regulator protein Sir2  32.81 
 
 		 303 aa  129  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0217965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1690  Silent information regulator protein Sir2  32.28 
 
 		 294 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  35.44 
 
 		 237 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  37.44 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  33.75 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0295  Silent information regulator protein Sir2  30.9 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.216345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14160  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  33.99 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  33.59 
 
 		 245 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1523  Silent information regulator protein Sir2  38.24 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>