More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1913 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 234 aa  477  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  44.74 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  45.19 
 
 		 244 aa  209  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  45.19 
 
 		 244 aa  209  4e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  45.73 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  46.67 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  45.33 
 
 		 247 aa  205  6e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  42.67 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  42.06 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  43.75 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  41.35 
 
 		 245 aa  181  7e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  37.4 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  41.42 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  42.15 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  41.89 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  41.89 
 
 		 237 aa  169  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  43.84 
 
 		 246 aa  168  9e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  42.65 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  42.03 
 
 		 251 aa  164  8e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  37.28 
 
 		 242 aa  164  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  40.16 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  42.22 
 
 		 252 aa  162  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  38.5 
 
 		 242 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  41.78 
 
 		 256 aa  161  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 251 aa  161  9e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  38.43 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  39.65 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  39.41 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  40.36 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  39.91 
 
 		 241 aa  155  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  36.52 
 
 		 269 aa  154  9e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  37.7 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1781  NAD-dependent deacetylase  37.07 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  36.73 
 
 		 253 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2228  NAD-dependent deacetylase  37.08 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2267  NAD-dependent deacetylase  37.08 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0957  silent information regulator protein Sir2  42.25 
 
 		 253 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.925274  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0295  Silent information regulator protein Sir2  35.66 
 
 		 283 aa  151  8.999999999999999e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.216345 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  41.74 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  36.53 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  36.19 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  38.99 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  37.75 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  39.66 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  36.75 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  41.44 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  37.67 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  38.91 
 
 		 264 aa  148  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  37.18 
 
 		 241 aa  148  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  35.59 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  35.86 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  39.57 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  38.65 
 
 		 278 aa  145  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  36.64 
 
 		 242 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  35.32 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  35.27 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  36.49 
 
 		 243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  37.56 
 
 		 256 aa  144  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  35.24 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  36.64 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  37.07 
 
 		 249 aa  142  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  35.78 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  36.21 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  36.21 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  37.79 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  35.78 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  35.78 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  35.78 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  38.18 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  32.47 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0484  Silent information regulator protein Sir2  30.58 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2843  NAD-dependent deacetylase  36.21 
 
 		 245 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  34.47 
 
 		 242 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2682  Silent information regulator protein Sir2  31.06 
 
 		 271 aa  137  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  35.24 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  34.74 
 
 		 249 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  35.21 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  34.74 
 
 		 249 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  34.2 
 
 		 253 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  35.98 
 
 		 263 aa  135  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  36.61 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8749  silent information regulator protein Sir2  30.59 
 
 		 293 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  34.05 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  34.22 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0217  Silent information regulator protein Sir2  32.21 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  32.43 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2078  silent information regulator protein Sir2  31.27 
 
 		 280 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0528  Silent information regulator protein Sir2  30.3 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.02282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  32.26 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  37.28 
 
 		 260 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  33.05 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  33.93 
 
 		 236 aa  132  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  33.19 
 
 		 251 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2641  silent information regulator protein Sir2  32.94 
 
 		 280 aa  131  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1482  Silent information regulator protein Sir2  32.44 
 
 		 274 aa  131  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  36.73 
 
 		 244 aa  131  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  34.6 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  34.38 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>