More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11175 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 		 237 aa  479  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  70.34 
 
 		 237 aa  337  7e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  70.34 
 
 		 237 aa  337  7e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  70.34 
 
 		 237 aa  337  7e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  66.38 
 
 		 236 aa  315  5e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  65.96 
 
 		 236 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  51.71 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  53.85 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  53.11 
 
 		 264 aa  232  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  51.44 
 
 		 306 aa  227  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  47.33 
 
 		 266 aa  223  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 269 aa  218  6e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  48.68 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  50.21 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 262 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  46.78 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  51.27 
 
 		 258 aa  209  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  49.78 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  49.13 
 
 		 241 aa  207  8e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  50 
 
 		 250 aa  207  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  46.72 
 
 		 248 aa  205  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  48.28 
 
 		 243 aa  204  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  45.34 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  45.89 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  46.75 
 
 		 249 aa  201  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  39.32 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  48.92 
 
 		 244 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  48.5 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  46.98 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  48.92 
 
 		 260 aa  198  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  46.12 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  46.12 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  46.19 
 
 		 284 aa  194  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  50.22 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  46.12 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  45.3 
 
 		 245 aa  188  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  43.98 
 
 		 258 aa  188  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  44.02 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  43.72 
 
 		 249 aa  185  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  47.35 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  46.32 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  43.4 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  44.74 
 
 		 244 aa  178  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  47.37 
 
 		 260 aa  178  8e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  42.34 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  47.11 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  43.84 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  40.53 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  39.13 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5448  Silent information regulator protein Sir2  41 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  41.1 
 
 		 242 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  38.19 
 
 		 273 aa  161  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  44.21 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  41.67 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  40.26 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  41.53 
 
 		 237 aa  158  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  35.84 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  43.1 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  41.2 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  38.98 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  39.66 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  37.61 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  37.93 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  37.93 
 
 		 252 aa  151  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  37.39 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  40.34 
 
 		 229 aa  151  8.999999999999999e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  37.5 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  41.45 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  36.84 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  38.56 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  41.74 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  37.66 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  37.56 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  37.56 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  43.75 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  33.19 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  35.78 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  39.15 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  40.85 
 
 		 230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  38.43 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  38.76 
 
 		 259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5013  silent information regulator protein Sir2  40.38 
 
 		 233 aa  145  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.408464  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  36.64 
 
 		 235 aa  144  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0531  Silent information regulator protein Sir2  38.08 
 
 		 227 aa  144  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000137862 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  34.89 
 
 		 256 aa  144  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  38.26 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  37.34 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  35.83 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  37.44 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2892  silent information regulator protein Sir2  39.33 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  35.95 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  34.31 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2817  silent information regulator protein Sir2  43.32 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  36.64 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  36.82 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>