More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1331 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  100 
 
 		 257 aa  537  9.999999999999999e-153  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  81.22 
 
 		 251 aa  427  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  45.68 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  39.43 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  40.83 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  37.1 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  36.14 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  37.04 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  36.99 
 
 		 244 aa  178  7e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  36.99 
 
 		 244 aa  178  7e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  35.34 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  38.15 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  38.27 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  39.43 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  36.1 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  35.42 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  35.37 
 
 		 251 aa  155  7e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  39.38 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  34.41 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  35.12 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  40.89 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  34.13 
 
 		 246 aa  152  7e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  37.65 
 
 		 250 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  34.71 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  35.68 
 
 		 247 aa  148  7e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  36.48 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  33.87 
 
 		 269 aa  143  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  34.98 
 
 		 253 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  34.51 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  34.15 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  35.68 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5254  NAD-dependent deacetylase  33.72 
 
 		 274 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  34.71 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  33.2 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  35.08 
 
 		 251 aa  138  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  34.55 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4037  putative transciptional regulatory Sir2-family protein  34.58 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.185162 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  37.86 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 245 aa  135  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3235  silent information regulator protein Sir2  32.6 
 
 		 309 aa  135  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429904  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  36.64 
 
 		 245 aa  135  9e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  34.26 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  34.9 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  35.37 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  34.06 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  34.02 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  34.73 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  31.12 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0501  NAD-dependent deacetylase  32.73 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  32.26 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  33.58 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  34.55 
 
 		 248 aa  132  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8513  Silent information regulator protein Sir2  33.46 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1962  Silent information regulator protein Sir2  33.72 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000762796  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  32.8 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2063  Silent information regulator protein Sir2  34.07 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1839  silent information regulator protein Sir2  33.59 
 
 		 294 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.056471  normal  0.640257 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  34.88 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  35.46 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1690  Silent information regulator protein Sir2  33.46 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  33.72 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03769  NAD-dependent deacetylase  32.46 
 
 		 293 aa  128  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0957  silent information regulator protein Sir2  35.48 
 
 		 253 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.925274  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  34.17 
 
 		 251 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  31.99 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3792  Silent information regulator protein Sir2  35.34 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56379  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  33.88 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5921  NAD-dependent deacetylase  32.82 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2641  silent information regulator protein Sir2  32.59 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1553  silent information regulator protein Sir2  34.3 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.469137  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  32.71 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  36.52 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08450  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00520)  34.35 
 
 		 2081 aa  125  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.601211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3942  silent information regulator protein Sir2  32.35 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.288967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3622  NAD-dependent deacetylase  33.59 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4461  NAD-dependent deacetylase  33.59 
 
 		 362 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3905  NAD-dependent deacetylase  33.59 
 
 		 362 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4678  NAD-dependent deacetylase  33.59 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  31.88 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  34.69 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0265  silent information regulator protein Sir2  31.58 
 
 		 299 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  33.2 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  34.01 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2468  Silent information regulator protein Sir2  32.58 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2495  silent information regulator protein Sir2  31.09 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.479866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  35.69 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  32.95 
 
 		 345 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  31.02 
 
 		 275 aa  122  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  33.2 
 
 		 245 aa  122  8e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  36.61 
 
 		 251 aa  122  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04510  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  32.72 
 
 		 268 aa  122  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.143323 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  31.35 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 249 aa  121  9e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  33.61 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  34.84 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  30.2 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  33.47 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  34.41 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  34.84 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>