More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1963 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 		 246 aa  494  1e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  79.92 
 
 		 269 aa  411  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  78.1 
 
 		 251 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  71.54 
 
 		 251 aa  384  1e-106  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  57.33 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  55.13 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  51.03 
 
 		 245 aa  241  7.999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  50.88 
 
 		 244 aa  237  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  52.21 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  50.64 
 
 		 248 aa  234  8e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  47.84 
 
 		 242 aa  231  6e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  47.01 
 
 		 249 aa  231  7.000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  45.67 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  54.58 
 
 		 250 aa  229  4e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  52.16 
 
 		 244 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  50.67 
 
 		 249 aa  225  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  51.28 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  50.2 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 247 aa  221  8e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  43.95 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  50.63 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  48.58 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  50.64 
 
 		 243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  49.57 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  52.79 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  48.54 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  46.47 
 
 		 262 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  50.86 
 
 		 249 aa  214  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  44.81 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  47.98 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  48.12 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  48.02 
 
 		 231 aa  211  7.999999999999999e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  41.87 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  47.95 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  48.91 
 
 		 245 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  45.68 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  45.19 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  48.47 
 
 		 230 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  50.62 
 
 		 250 aa  204  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  51.09 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  44.35 
 
 		 252 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  51.67 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  50.43 
 
 		 246 aa  201  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  42.86 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  42.56 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  46.81 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  46.81 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  46.81 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  42.06 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  41.74 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  48.51 
 
 		 236 aa  192  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  46.34 
 
 		 258 aa  190  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  43.93 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  40.17 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  40.17 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  43.39 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  46.73 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  41.98 
 
 		 256 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  44.59 
 
 		 232 aa  185  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  46.61 
 
 		 236 aa  185  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  37.79 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  45.06 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  41.32 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  43.33 
 
 		 243 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  41.67 
 
 		 244 aa  182  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  44.16 
 
 		 233 aa  183  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  45.49 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  42.98 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  43.1 
 
 		 243 aa  181  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  42.55 
 
 		 244 aa  179  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  39.91 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  40.25 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  45.02 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  42.19 
 
 		 256 aa  178  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  42.24 
 
 		 259 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  43.57 
 
 		 242 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  41.53 
 
 		 242 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  38.98 
 
 		 242 aa  177  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  45.69 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  43.56 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0207  NAD-dependent deacetylase  42.92 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  43.88 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  41.88 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  42.55 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  38.56 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1938  NAD-dependent deacetylase  42.31 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  42.13 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  40.74 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  41.88 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  42.13 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  42.74 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  42.62 
 
 		 278 aa  175  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  37.71 
 
 		 242 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  41.53 
 
 		 248 aa  175  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  41.25 
 
 		 246 aa  175  7e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  37.71 
 
 		 242 aa  175  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  42.98 
 
 		 249 aa  174  8e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>