More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_33150 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  100 
 
 		 243 aa  487  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  56.17 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  51.67 
 
 		 249 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  53.09 
 
 		 244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  51.67 
 
 		 248 aa  234  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  54.08 
 
 		 233 aa  234  9e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  53.62 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  51.07 
 
 		 244 aa  228  8e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  50.42 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  52.1 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  53.68 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  49.39 
 
 		 258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  52.81 
 
 		 249 aa  221  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  52.08 
 
 		 256 aa  221  9e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  54.25 
 
 		 255 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  50.21 
 
 		 269 aa  218  7e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  52.59 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  51.67 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  50.64 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  51.52 
 
 		 249 aa  216  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  51.2 
 
 		 258 aa  214  8e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  51.69 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  54.74 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  47.97 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  54.39 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  51.52 
 
 		 244 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  45.96 
 
 		 259 aa  209  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  47.62 
 
 		 273 aa  208  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  48.79 
 
 		 251 aa  207  8e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  48.5 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  41.98 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  48.5 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  53.45 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  48.07 
 
 		 237 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  49.58 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  48.28 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  46.86 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  48.21 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  44.68 
 
 		 259 aa  201  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  45.2 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  45.57 
 
 		 264 aa  195  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 262 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  44.03 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  47.84 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  46.25 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  44.2 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  46.44 
 
 		 284 aa  188  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  45.45 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  45.49 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  47.41 
 
 		 236 aa  184  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  48.89 
 
 		 260 aa  174  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  41.98 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  48.4 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  40.25 
 
 		 247 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  41.85 
 
 		 248 aa  171  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  43.95 
 
 		 242 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  43.05 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  42.01 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  46.61 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  45.49 
 
 		 241 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  41.15 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  42.37 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  42.74 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  41.45 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  46.19 
 
 		 243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  42.42 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  42.61 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  39.09 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  42.42 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  44.87 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  41.99 
 
 		 276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0294  Silent information regulator protein Sir2  43.86 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  40.85 
 
 		 251 aa  162  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  44.64 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  42.11 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  41.88 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  41.67 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  41.67 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  41.7 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  40.85 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  41.23 
 
 		 278 aa  158  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  41.81 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  43.85 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  44.05 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  41.38 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  41.38 
 
 		 279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  41.38 
 
 		 279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  41.38 
 
 		 279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  41.38 
 
 		 279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  41.38 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  41.38 
 
 		 279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  41.38 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  38.91 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  41.48 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  45.45 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  41.23 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  42.42 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  47.47 
 
 		 239 aa  152  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  42.98 
 
 		 230 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  37.93 
 
 		 275 aa  150  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>