More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0872 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 		 251 aa  499  1e-140  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  78.1 
 
 		 246 aa  399  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  70.4 
 
 		 251 aa  382  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  74.49 
 
 		 269 aa  381  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  59.73 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  54.96 
 
 		 256 aa  247  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  54.55 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  51.03 
 
 		 245 aa  238  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  47.81 
 
 		 266 aa  237  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  51.44 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  52.38 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  50.62 
 
 		 248 aa  231  9e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  45.71 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  47.35 
 
 		 242 aa  229  3e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  54.4 
 
 		 250 aa  229  4e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  50.65 
 
 		 231 aa  228  6e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  46.15 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  53.14 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 262 aa  224  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  50.21 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  46.94 
 
 		 245 aa  223  3e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  53.71 
 
 		 244 aa  221  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  47.76 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  51.88 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  52.19 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  46.12 
 
 		 262 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  50.41 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  50.79 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  51.67 
 
 		 243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  48.58 
 
 		 265 aa  214  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  51.74 
 
 		 249 aa  214  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  47.35 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  51.3 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  51.61 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  46.28 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  47.54 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  46.41 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  49.41 
 
 		 258 aa  208  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  46.84 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  51.44 
 
 		 255 aa  205  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  47.43 
 
 		 273 aa  205  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  51.77 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  53.45 
 
 		 241 aa  205  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  53.25 
 
 		 244 aa  204  9e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  52.87 
 
 		 250 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  41.92 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  44.83 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  47.62 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  53.14 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  45.89 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  45.89 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  45.89 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  42.32 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  44.72 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  42.2 
 
 		 244 aa  193  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  42.2 
 
 		 244 aa  193  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  46.75 
 
 		 236 aa  192  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  41.13 
 
 		 243 aa  191  9e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  44.25 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  47.37 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  46.05 
 
 		 243 aa  188  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  43.62 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  43.62 
 
 		 278 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  46.03 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  45.49 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  45.49 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  45.49 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  45.49 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  45.49 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  47.62 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  43.21 
 
 		 278 aa  185  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  45.68 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  45.68 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  43.97 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  45.68 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  45.68 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  45.68 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  45.68 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  44.92 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  42.62 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  45.49 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  45.45 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  45.45 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  47.6 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  45.34 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  43.5 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  44.3 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  44.07 
 
 		 242 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  47.62 
 
 		 243 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  44.1 
 
 		 237 aa  182  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  43.67 
 
 		 252 aa  181  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  43.04 
 
 		 251 aa  181  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  46.81 
 
 		 273 aa  181  9.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  44.44 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  44.3 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  46.9 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  43.1 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  47.88 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>