More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1341 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 233 aa  454  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  61.37 
 
 		 248 aa  274  9e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  63.09 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  60.43 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  55.08 
 
 		 249 aa  255  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  56.03 
 
 		 248 aa  255  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  57.96 
 
 		 269 aa  254  8e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  59.91 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  57.33 
 
 		 246 aa  249  3e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  59.73 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  58.23 
 
 		 244 aa  246  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  55.84 
 
 		 249 aa  244  8e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  57.76 
 
 		 241 aa  240  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  49.79 
 
 		 266 aa  238  5.999999999999999e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  58.15 
 
 		 244 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  55.51 
 
 		 258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  54.08 
 
 		 243 aa  234  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  54.98 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  54.55 
 
 		 249 aa  231  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  53.28 
 
 		 244 aa  232  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  49.15 
 
 		 249 aa  231  7.000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  55.17 
 
 		 246 aa  228  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  56.83 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  48.91 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  48.35 
 
 		 252 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  49.56 
 
 		 259 aa  221  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  50.41 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  54.39 
 
 		 245 aa  218  5e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  48.71 
 
 		 244 aa  218  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  50.66 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  54.77 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  53.14 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  48.98 
 
 		 264 aa  211  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  50.6 
 
 		 265 aa  211  5.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  50.43 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  49.78 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  43.29 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  53.53 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  52.32 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  48.96 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  44.67 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  45.93 
 
 		 273 aa  199  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  45.81 
 
 		 243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  51.11 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  51.11 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  46.72 
 
 		 237 aa  193  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  46.72 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  46.72 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  43.03 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  48.03 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  44.55 
 
 		 230 aa  184  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  45.34 
 
 		 259 aa  181  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  46.58 
 
 		 276 aa  181  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  45.41 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  44.74 
 
 		 276 aa  178  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  41.41 
 
 		 230 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  46.46 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  43.91 
 
 		 243 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  43.91 
 
 		 243 aa  178  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  41.88 
 
 		 235 aa  177  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  47.32 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  45.3 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  44.49 
 
 		 278 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  41.92 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  39.15 
 
 		 251 aa  175  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  42.92 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  44.16 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  48.9 
 
 		 250 aa  174  7e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  46.75 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  41.3 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  46.72 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  47.56 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  44.05 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  46.75 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  44.05 
 
 		 278 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  44.16 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  46.72 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  41.38 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  46.22 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  43.72 
 
 		 246 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  44.26 
 
 		 248 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  45.37 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  45.37 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  45.37 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  45.37 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  45.37 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  45.49 
 
 		 252 aa  171  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  45.81 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  45.81 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  45.81 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  45.81 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  43.04 
 
 		 240 aa  170  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  45.81 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  45.81 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  45.81 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  45.37 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  43.67 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  43.67 
 
 		 243 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>