More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3017 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 245 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  66.81 
 
 		 260 aa  295  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  66.38 
 
 		 260 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  60.09 
 
 		 284 aa  281  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  55.74 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  56.84 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  56.84 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  56.17 
 
 		 246 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  54 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  53.97 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  48.57 
 
 		 249 aa  211  5.999999999999999e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  49.16 
 
 		 248 aa  208  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  49.58 
 
 		 243 aa  205  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  48.97 
 
 		 256 aa  198  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  49.37 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  45.56 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  45.96 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  49.79 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  48.7 
 
 		 248 aa  192  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  44.57 
 
 		 306 aa  189  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  46.91 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  41.32 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  40.56 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  43.03 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  46.61 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  46.89 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  47.97 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  45.92 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  46.32 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  42.57 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  45.02 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  47.93 
 
 		 250 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  40.76 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  38.17 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  42.8 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  40.43 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  41.13 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  45.18 
 
 		 251 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  45.31 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  39.13 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  42.54 
 
 		 242 aa  168  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  44.21 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  44.21 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  44.21 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  47.01 
 
 		 236 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  45.61 
 
 		 236 aa  162  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  40.72 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  42.37 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  41.63 
 
 		 265 aa  155  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  39.24 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  39.91 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  38.63 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  39.91 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  40.89 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  39.26 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  38.53 
 
 		 230 aa  151  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  38.49 
 
 		 248 aa  151  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  44.34 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  37.3 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  41.09 
 
 		 230 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01782  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09210)  33.97 
 
 		 320 aa  149  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  44.34 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  39.32 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  43.56 
 
 		 235 aa  148  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1797  NAD-dependent deacetylase  40.27 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0401788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  44.49 
 
 		 232 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  39.06 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  43.16 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  43.22 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  38.59 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  40.27 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  39.83 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  40.76 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  39.91 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  37.61 
 
 		 230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  39.83 
 
 		 278 aa  144  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  37.45 
 
 		 242 aa  144  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  39.83 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  38.82 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  36.09 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  36.75 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  40.58 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  40.27 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  40.17 
 
 		 240 aa  142  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  40.09 
 
 		 278 aa  141  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  42.42 
 
 		 226 aa  141  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0371  silent information regulator protein Sir2  42.93 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157699 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  38.89 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  40.83 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  36.67 
 
 		 279 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  40.5 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  32.78 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>