More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1662 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 		 248 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  87.65 
 
 		 258 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  86.92 
 
 		 254 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1797  NAD-dependent deacetylase  85.65 
 
 		 241 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0401788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2621  NAD-dependent deacetylase  83.75 
 
 		 243 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000617513  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  83.75 
 
 		 243 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  83.33 
 
 		 243 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  83.75 
 
 		 243 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  83.61 
 
 		 246 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  83.61 
 
 		 246 aa  421  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  84.03 
 
 		 247 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1938  NAD-dependent deacetylase  83.61 
 
 		 243 aa  420  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  81.59 
 
 		 244 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  78.33 
 
 		 240 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  75.53 
 
 		 248 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1594  NAD-dependent deacetylase  70.29 
 
 		 253 aa  351  5.9999999999999994e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000756784  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  60 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  58.3 
 
 		 251 aa  292  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  58.05 
 
 		 243 aa  288  6e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  59.48 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  58.3 
 
 		 259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  60 
 
 		 276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  58.04 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  60.17 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  54.98 
 
 		 242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  60.89 
 
 		 276 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  59.91 
 
 		 278 aa  281  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  59.83 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  58.95 
 
 		 278 aa  278  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  58.44 
 
 		 273 aa  278  8e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  58.44 
 
 		 273 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  58.44 
 
 		 273 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  58.44 
 
 		 273 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  58.44 
 
 		 273 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  58.44 
 
 		 273 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  58.01 
 
 		 279 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  58.01 
 
 		 279 aa  276  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  58.01 
 
 		 279 aa  276  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  58.01 
 
 		 279 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  58.01 
 
 		 279 aa  276  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  58.01 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  58.01 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  58.77 
 
 		 278 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  58.77 
 
 		 278 aa  275  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  55.56 
 
 		 243 aa  275  6e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  57.58 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1652  NAD-dependent deacetylase  61.3 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  56.6 
 
 		 243 aa  264  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  53.48 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  52.99 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  54.31 
 
 		 232 aa  238  6.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0264  Silent information regulator protein Sir2  53.14 
 
 		 246 aa  238  8e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0207  NAD-dependent deacetylase  51.52 
 
 		 234 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  51.27 
 
 		 239 aa  221  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  49.79 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  49.57 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  48.51 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  49.13 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  51.07 
 
 		 239 aa  216  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  49.12 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3226  NAD-dependent deacetylase  48.7 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3964  NAD-dependent deacetylase  48.7 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2492  Silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.340996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2216  silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  45.34 
 
 		 235 aa  189  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2817  silent information regulator protein Sir2  53.72 
 
 		 225 aa  188  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5013  silent information regulator protein Sir2  49.48 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.408464  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  48.69 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0371  silent information regulator protein Sir2  45.26 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157699 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  43.88 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  42.49 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  47.85 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  41.8 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  41.88 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0531  Silent information regulator protein Sir2  49.21 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000137862 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2612  NAD-dependent deacetylase  45.73 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000726932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  41.92 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  44.16 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2892  silent information regulator protein Sir2  51.34 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  41.74 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5448  Silent information regulator protein Sir2  46.84 
 
 		 229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  42.17 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  42.49 
 
 		 245 aa  172  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  37.66 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  40.95 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  39.66 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  41.92 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  40.52 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  41.45 
 
 		 244 aa  161  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  43.16 
 
 		 234 aa  161  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  40.43 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  39.57 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  40 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1154  conserved hypothetical protein, putative NAD-dependent deacetylase  40 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000113398  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  39.37 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  40 
 
 		 252 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  41.38 
 
 		 241 aa  152  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  37.25 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  39.29 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  40.85 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>