More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0527 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 230 aa  481  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  48.88 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  48.47 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  47.16 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  45.05 
 
 		 244 aa  197  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  43.75 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  44.25 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  42.42 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  44.2 
 
 		 243 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  43.95 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  44.69 
 
 		 241 aa  184  9e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  40 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  42.26 
 
 		 243 aa  179  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  42.79 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  41.41 
 
 		 233 aa  179  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  43.17 
 
 		 249 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  42.73 
 
 		 249 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  40.69 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  41.23 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  41.13 
 
 		 243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  42.37 
 
 		 250 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  42.17 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  39.24 
 
 		 266 aa  171  6.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  43.05 
 
 		 246 aa  170  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  39.3 
 
 		 235 aa  169  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  40.87 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  41.56 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  40.52 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  42.26 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0207  NAD-dependent deacetylase  40.79 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  40.97 
 
 		 276 aa  168  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  39.04 
 
 		 258 aa  167  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  40.53 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  41.55 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  40.89 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  41.3 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  41.52 
 
 		 243 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  37.66 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  39.83 
 
 		 237 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  39.82 
 
 		 242 aa  164  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  40.79 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  39.91 
 
 		 278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1797  NAD-dependent deacetylase  38.96 
 
 		 241 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0401788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  40.52 
 
 		 235 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  40.25 
 
 		 252 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  37.04 
 
 		 258 aa  162  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  39.91 
 
 		 278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  38.67 
 
 		 279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  38.67 
 
 		 279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  38.67 
 
 		 279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  38.67 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  38.67 
 
 		 279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  39.91 
 
 		 278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  38.67 
 
 		 279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  38.67 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  38.67 
 
 		 273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  39.04 
 
 		 243 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  40.26 
 
 		 240 aa  161  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  38.6 
 
 		 243 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  39.11 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  38.6 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2621  NAD-dependent deacetylase  38.6 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000617513  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1938  NAD-dependent deacetylase  39.3 
 
 		 243 aa  159  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  38.67 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  38.67 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  38.67 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  38.67 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  38.67 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  38.74 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  40.89 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  38.21 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  38.4 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  38.82 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  40.08 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  38.16 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  37.28 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  40.44 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0264  Silent information regulator protein Sir2  38.2 
 
 		 246 aa  158  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  39.56 
 
 		 278 aa  158  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  38.16 
 
 		 246 aa  157  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  37.18 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  37.72 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  38.07 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1594  NAD-dependent deacetylase  38.53 
 
 		 253 aa  155  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000756784  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  37.72 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  40.25 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  38.94 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0294  Silent information regulator protein Sir2  37.33 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  37.93 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  38.6 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  35.34 
 
 		 244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  39.82 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  36.71 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  38.24 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  38.24 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  38.53 
 
 		 245 aa  151  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  38.24 
 
 		 237 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  37.66 
 
 		 239 aa  151  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  36.84 
 
 		 273 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>