More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0457 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 
266 aa  554  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  60.94 
 
 
249 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  49.79 
 
 
233 aa  238  8e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  47.81 
 
 
251 aa  237  1e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  45.67 
 
 
246 aa  231  1e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  45.78 
 
 
269 aa  230  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  47.04 
 
 
251 aa  230  2e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  46.03 
 
 
306 aa  226  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  47.76 
 
 
248 aa  225  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  47.33 
 
 
237 aa  223  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  44.92 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  48.9 
 
 
273 aa  219  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  46.53 
 
 
244 aa  217  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  47.97 
 
 
243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  44.94 
 
 
249 aa  211  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  45.35 
 
 
260 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  44.53 
 
 
249 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  46.25 
 
 
244 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  44.14 
 
 
252 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  47.27 
 
 
255 aa  206  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  47.95 
 
 
249 aa  205  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  47.56 
 
 
256 aa  204  9e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  40.61 
 
 
262 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  43.32 
 
 
246 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  40.68 
 
 
262 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  46.56 
 
 
248 aa  203  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  45.97 
 
 
250 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  44.19 
 
 
258 aa  198  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  47.11 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  44.44 
 
 
245 aa  194  9e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  46.15 
 
 
250 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  42.39 
 
 
236 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  44.58 
 
 
244 aa  192  5e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  39.76 
 
 
251 aa  191  9e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  43.03 
 
 
241 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  41.67 
 
 
237 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  41.67 
 
 
237 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  41.67 
 
 
237 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  43.09 
 
 
245 aa  189  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  40.56 
 
 
245 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  42.86 
 
 
284 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  42.99 
 
 
249 aa  186  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  44.3 
 
 
235 aa  186  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1594  NAD-dependent deacetylase  45.42 
 
 
253 aa  186  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000756784  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  42.17 
 
 
242 aa  185  8e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  41.15 
 
 
236 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  44.63 
 
 
248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  40.96 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  41.54 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  43.85 
 
 
243 aa  181  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  42.62 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  42.15 
 
 
243 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  43.57 
 
 
244 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  42.56 
 
 
243 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  43.15 
 
 
247 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  43.15 
 
 
246 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1938  NAD-dependent deacetylase  42.32 
 
 
243 aa  178  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2621  NAD-dependent deacetylase  42.15 
 
 
243 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000617513  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
251 aa  177  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  43.72 
 
 
243 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  42.32 
 
 
243 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  38.78 
 
 
259 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  44.81 
 
 
240 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  41.8 
 
 
248 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  44.86 
 
 
243 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  44.72 
 
 
242 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  42.74 
 
 
246 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  44.29 
 
 
259 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  41.5 
 
 
237 aa  175  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  41.67 
 
 
230 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  41.39 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  41.7 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  38.52 
 
 
259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  48.84 
 
 
226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  39.24 
 
 
230 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  42.68 
 
 
233 aa  170  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1797  NAD-dependent deacetylase  41.08 
 
 
241 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0401788  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  41.77 
 
 
237 aa  169  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  42.08 
 
 
260 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  42.08 
 
 
260 aa  168  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  42.21 
 
 
278 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  41.8 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  40.83 
 
 
232 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  41.8 
 
 
278 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  41.22 
 
 
273 aa  165  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  43.44 
 
 
237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  40.74 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  41.13 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  41.74 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  40.48 
 
 
278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  43.38 
 
 
239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  44.95 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  40.83 
 
 
239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  40.73 
 
 
279 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  40.73 
 
 
279 aa  163  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  40.73 
 
 
279 aa  163  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  40.73 
 
 
273 aa  163  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  40.73 
 
 
279 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  40.73 
 
 
273 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  43.52 
 
 
241 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>