More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2348 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  63.97 
 
 		 262 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  63.35 
 
 		 262 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  60.67 
 
 		 256 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  64.25 
 
 		 230 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  55.1 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  54.32 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  50.4 
 
 		 258 aa  234  8e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  47.33 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  48.35 
 
 		 233 aa  225  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  50.42 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  47.92 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  51.14 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  48.73 
 
 		 247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  47.54 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  47.28 
 
 		 269 aa  211  9e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  44.14 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  45.68 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  46.06 
 
 		 249 aa  205  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  45.23 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  44.35 
 
 		 246 aa  203  3e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  44.31 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  46.83 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  44.27 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  45.89 
 
 		 237 aa  202  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  45.2 
 
 		 243 aa  201  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  40.64 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  44.67 
 
 		 273 aa  198  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  45.04 
 
 		 246 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  43.28 
 
 		 251 aa  194  9e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  42.56 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  45.64 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  43.53 
 
 		 237 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  43.53 
 
 		 237 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  43.53 
 
 		 237 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  43.15 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  44.58 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  42.26 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  44.3 
 
 		 284 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  38.96 
 
 		 242 aa  182  6e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  42.57 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  42.86 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  40.24 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  44.26 
 
 		 244 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4319  silent information regulator protein Sir2  64.06 
 
 		 131 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  44.09 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  42.42 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  40.17 
 
 		 265 aa  168  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  42.67 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  39.59 
 
 		 245 aa  168  7e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  42.74 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  42.24 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  40.25 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  39.18 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  37.99 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  36.4 
 
 		 259 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  40.19 
 
 		 259 aa  158  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  37.65 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  37.5 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  41.7 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  40 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  39.74 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.870282 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  35.68 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  37.55 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  38.66 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  41.03 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  42.62 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  39.09 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  40.32 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  39.58 
 
 		 237 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  39.75 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  36.8 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  38.66 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  37.45 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  39.18 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  36.97 
 
 		 254 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  34.65 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  38.06 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  37.65 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  37.65 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2621  NAD-dependent deacetylase  37.65 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000617513  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1515  Silent information regulator protein Sir2  38.89 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0609928  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  36.13 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  38.49 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  38.49 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1797  NAD-dependent deacetylase  37.86 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0401788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  38.49 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  38.49 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  38.49 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  34.96 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  37.96 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  35.6 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  38.03 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  38.37 
 
 		 244 aa  142  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  36.17 
 
 		 254 aa  141  9e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  37.39 
 
 		 273 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  38.14 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  37.96 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  38.17 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>